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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000965`

染色体: Chr08 坐标: 7183573-7187093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000965`
名称	SmilChr08G000965
描述	probable CoA ligase CCL7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7183573 - 7187093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000559`
GeneID	`131000559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000559`
原始查询	`LOC131000559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable CoA ligase CCL7
产物	probable CoA ligase CCL7
Arabidopsis	`AT4G05160` (AT4G05160) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825864] identity=67.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0152400` (OsACS1) - identity=57.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057782534.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057782534.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782534.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782534.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7183742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B140,B26,B33,B76
`Chr8:7183929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B3,B58,C31,C78
`Chr8:7183934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:7184074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C29,D4
`Chr8:7184189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:7184232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:7184239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:7184284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:7184381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C10,C3
`Chr8:7184706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A5,B82,B83,D3
`Chr8:7184706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B82,B83,D3
`Chr8:7185680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782534.1

545 aa

272

545

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 35-405 aa PF13193 AMP-binding_C 456-531 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782534.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	35	405	7.1e-91	305.6	AMP-binding enzyme
`XP_057782534.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	456	531	2e-17	64.6	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926551.1
GTGAGGTAATTAAATTAAATGACGATAGATTTTGTTTGCTTGCATAATGGGATAATCGGTTTCTACCGGTTGTGGGAAAATGTGATTAAATGCGAGGCCAGCTACAACATTGAGTTCTGGAAATTCGCTGTAATCATTGATACTCCACTACAAAGAAGATGGAGAAATCCGGTTATGGCCGCGACGGCGTGTTCCGATCTCTGCGCCCGCCGTTATCCCTTCCCACAAACCCCAACCTCTCCTTGGTCTCCTTCCTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000559
ATGGAGAAATCCGGTTATGGCCGCGACGGCGTGTTCCGATCTCTGCGCCCGCCGTTATCCCTTCCCACAAACCCCAACCTCTCCTTGGTCTCCTTCCTCTTCAGAAACACTTCGTCCTTCGCCGAAAAACGCGCCCTAATCGACGCGCACACCGGCGAAACCCTCACTTTCTCTCACTTCAAATCCATGGTTTCCAGAGTCGCCCACGGCTTGCTCCAGCTCGGCATCAAGAAAAACGACGTTGTCCTCATTTTCTCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782534.1
MEKSGYGRDGVFRSLRPPLSLPTNPNLSLVSFLFRNTSSFAEKRALIDAHTGETLTFSHFKSMVSRVAHGLLQLGIKKNDVVLIFSPNSIQFPLCFFGIIAIGAVATTVNPVYTAREVSKQLKDSMAKMIITVEELLPKVNDFDLPIILLGDSEKPVSPNGRTPKITLFSKLVENEGSVDIDGNSFGIKQNDTAALLYSSGTTGASKGVILTHRNFIASSQMITADQEMAGEVNCVFMCVLPMFHVFGLAVIMLSQLQRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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