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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G001126

染色体: Chr08 坐标: 8761241-8769677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G001126
名称SmilChr08G001126
描述uncharacterized SmilChr08G001126
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向8761241 - 8769677 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131000708
GeneID131000708
locus_tag-
NCBI 名称LOC131000708
原始查询LOC131000708

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823705]; symbol=AT3G45630; hit=AT3G45630; species=arabidopsis; confidence=high
产物RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823705]; symbol=AT3G45630; hit=AT3G45630; species=arabidopsis; confidence=high
拟南芥AT3G45630 (AT3G45630)
RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823705]
identity=45.08; qcov=0.988; evalue=0.0; confidence=high
水稻Os11g0102800 (OsRINGC2-1)
-
identity=63.34; qcov=0.328; evalue=1.06e-142; confidence=low
GOGO:0003723 (RNA binding); GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0030014 (CCR4-NOT complex)
KEGGsmil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF00076 (RRM_1); PF14570 (zf-RING_4)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131000708

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 细胞核 1.00000 SmilChr08G001126.1
2 细胞质核糖核蛋白颗粒 0.80000 SmilChr08G001126.5
3 细胞质颗粒 0.60000 SmilChr08G001126.1
4 细胞质 0.60000 SmilChr08G001126.3
5 加工体（P-body） 0.60000 SmilChr08G001126.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:8763415 C CAA 2bp_insertion frameshift_variant 9 A16,B137,B38,B7,B85,C27,C75,C87,D2
Chr8:8763417 CCT C 2bp_deletion frameshift_variant 6 B137,B7,B85,C27,C87,D2
Chr8:8763628 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B13,B68
Chr8:8763645 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B88
Chr8:8766369 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B49
Chr8:8766410 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B74,C73
Chr8:8766855 AG A 1bp_deletion frameshift_variant 1 B70
Chr8:8766855 AG A 1bp_deletion CDS_variant 1 B70
Chr8:8767510 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A24
Chr8:8767544 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B70
Chr8:8768331 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B61
Chr8:8768582 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G001126.1
来源蛋白: XP_057782726.1
1026 aa
N
1
513
1026
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.2
来源蛋白: XP_057782727.1
1026 aa
N
1
513
1026
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.3
来源蛋白: XP_057782728.1
1025 aa
N
1
512
1025
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.4
来源蛋白: XP_057782729.1
1025 aa
N
1
512
1025
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.5
来源蛋白: XP_057782730.1
1024 aa
N
1
512
1024
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.6
来源蛋白: XP_057782731.1
1024 aa
N
1
512
1024
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.7
来源蛋白: XP_057782732.1
1023 aa
N
1
512
1023
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
SmilChr08G001126.8
来源蛋白: XP_057782733.1
1023 aa
N
1
512
1023
zf-RING_4
RRM_1
C
PF14570 zf-RING_4 21-73 aa PF00076 RRM_1 124-202 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr08G001126.1
XP_057782726.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 2e-19 69.8 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.1
XP_057782726.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.2
XP_057782727.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 2e-19 69.8 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.2
XP_057782727.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.3
XP_057782728.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 2e-19 69.8 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.3
XP_057782728.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.4
XP_057782729.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 2e-19 69.8 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.4
XP_057782729.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.5
XP_057782730.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 1.9e-19 69.9 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.5
XP_057782730.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.6
XP_057782731.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 1.9e-19 69.9 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.6
XP_057782731.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.7
XP_057782732.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 1.9e-19 69.9 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.7
XP_057782732.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif
SmilChr08G001126.8
XP_057782733.1		 Pfam PF14570 zf-RING_4 Domain 21 73 1.9e-19 69.9 RING/Ubox like zinc-binding domain
SmilChr08G001126.8
XP_057782733.1		 Pfam PF00076 RRM_1 Domain 124 202 5e-06 27.0 RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA
XM_057926744.1
GGCGTATTGTGCAGTAGAAAAACAAAGAAAAAAAAGTCCAAGACGGTAGCTGTGTTAAGTTGGGAGTTATCGAATCGAGCCGAATGGGATCAGACACAGATAGGAACAGCATAAAAGGACCCAACTTCCAAATCCAACCCTTTCTCTTTTCTCACTCCAATTCTCTGTCTGAATACTGTTTTCTTTGTGGCTCTCTCTCTCTATATCTCCACATCCCTCTGCACCTTGTATCCTTTCTTTTCGATCCAATCATCCATTCT...
XM_057926746.1
GGCGTATTGTGCAGTAGAAAAACAAAGAAAAAAAAGTCCAAGACGGTAGCTGTGTTAAGTTGGGAGTTATCGAATCGAGCCGAATGGGATCAGACACAGATAGGAACAGCATAAAAGGACCCAACTTCCAAATCCAACCCTTTCTCTTTTCTCACTCCAATTCTCTGTCTGAATACTGTTTTCTTTGTGGCTCTCTCTCTCTATATCTCCACATCCCTCTGCACCTTGTATCCTTTCTTTTCGATCCAATCATCCATTCT...

CDS

8 records

下载 CDS FASTA
SmilChr08G001126.1 (XP_057782726.1)
ATGGCCAAGTCAAATCTTCTAATTAATCAGGCGACCATGAGCGACGAAGGAGAGAAGACTTGCCCCCTCTGTGCTGAGGAGATGGATTTAACTGATCAGCAGTTAAAGCCTTGCAAGTGTGGCTATGAGATTTGTGTTTGGTGTTGGCATCAAATTATAGATATGGCTGAGAAAGATGATACTGAAGGGCGCTGTCCAGCATGTCGTACTCCTTATAACAAGGAAAAGATTGTTGGAACGACTGCAAAATGTGAAAGATT...
SmilChr08G001126.2 (XP_057782727.1)
ATGGCCAAGTCAAATCTTCTAATTAATCAGGCGACCATGAGCGACGAAGGAGAGAAGACTTGCCCCCTCTGTGCTGAGGAGATGGATTTAACTGATCAGCAGTTAAAGCCTTGCAAGTGTGGCTATGAGATTTGTGTTTGGTGTTGGCATCAAATTATAGATATGGCTGAGAAAGATGATACTGAAGGGCGCTGTCCAGCATGTCGTACTCCTTATAACAAGGAAAAGATTGTTGGAACGACTGCAAAATGTGAAAGATT...

Protein

8 records

下载 Protein FASTA
SmilChr08G001126.1 (XP_057782726.1)
MAKSNLLINQATMSDEGEKTCPLCAEEMDLTDQQLKPCKCGYEICVWCWHQIIDMAEKDDTEGRCPACRTPYNKEKIVGTTAKCERLVTEMSVEKKLKSQKGKSKALEGRKQLGSVRVIQRNLVYVVGLPLNFADEDLLQRREYFGQYGKVLKVSISRTATGAIQQFANSTCSVYITYSREEEAVRCIQLVHGFSLDGKPLRACFGTTKYCHAWLRNMPCSNPDCLYLHDIGSQEDSFTKDEVISAYTRSRIQQVTSSST...
SmilChr08G001126.2 (XP_057782727.1)
MAKSNLLINQATMSDEGEKTCPLCAEEMDLTDQQLKPCKCGYEICVWCWHQIIDMAEKDDTEGRCPACRTPYNKEKIVGTTAKCERLVTEMSVEKKLKSQKGKSKALEGRKQLGSVRVIQRNLVYVVGLPLNFADEDLLQRREYFGQYGKVLKVSISRTATGAIQQFANSTCSVYITYSREEEAVRCIQLVHGFSLDGKPLRACFGTTKYCHAWLRNMPCSNPDCLYLHDIGSQEDSFTKDEVISAYTRSRIQQVTSSST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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