Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001299`

染色体: Chr08 坐标: 10342359-10344551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G001299`
名称	SmilChr08G001299
描述	stress enhanced protein 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10342359 - 10344551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000924`
GeneID	`131000924`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131000924`
原始查询	`LOC131000924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stress enhanced protein 1, chloroplastic
产物	stress enhanced protein 1%2C chloroplastic
拟南芥	`AT4G34190` (SEP1) stress enhanced protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829567] identity=68.27; qcov=0.739; evalue=1.17e-40; confidence=medium
水稻	`Os11g0621400` - identity=46.47; qcov=0.674; evalue=6.24e-23; confidence=medium
GO	GO:0071486 (cellular response to high light intensity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000924

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	叶绿体	1.00000	`XP_057783055.1`
2	叶绿体类囊体	1.00000	`XP_057783055.1`
3	叶绿体类囊体膜	1.00000	`XP_057783056.1`
4	叶绿体基质	0.20000	`XP_057783055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10343304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B118,B18,B70
`Chr8:10343565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr8:10343565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927072.1
GATCTATATCTATATATTAATTAAAGAGTTTATAAAATTCGCATCTTATTTGGAGAACGGACCAGACGGAGTAATAAGAATCGAATACATCCTAATTAGAAGAAGGGAATGAGAGAATTTTCTGATCTTCGTTAATCGAAAAATATGGTGCAACAAAAATTGGAAACTAATAAGTAACTTACTAACTGAAAGCTAATCCTTTCAGAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAGAAGTAAGAGACGGCTATAGCGTGTAAGTTGTGCA...

XM_057927073.1
ATTTGGAGAACGGACCAGACGGAGTAATAAGAATCGAATACATCCTAATTAGAAGAAGGGAATGAGAGAATTTTCTGATCTTCGTTAATCGAAAAATATGGTGCAACAAAAATTGGAAACTAATAAGTAACTTACTAACTGAAAGCTAATCCTTTCAGAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAGAAGTAAGAGACGGCTATAGCGTGTAAGTTGTGCAGGACAAGTGTCGGATTCCCCATTGCTTCCTCACCTCTCAAATTTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783056.1_41912
ATGGCGGCCGCCGTGCTATCTTCTTCTTCTCTCTGTTGCTACGCCTCCTTTCGCGATATTCGTATACCTCATCCGGCAAAATTAGCTTCTGCTCCTCGTGAATTCGGCACCGCATTCGCCACTGGTTCCCCTCTCTCGATTCGGACACCAATCTACAGGAGAAAGGCTGCTCGCAGTTCAACATCAGTGTCTGTAAGATGTGAGCAGAGTACAAAAGGCAATGGTTTAGATGTATGGCTGGGACGACTCGCTATGGTTGG...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783055.1_41913
ATGGCGGCCGCCGTGCTATCTTCTTCTTCTCTCTGTTGCTACGCCTCCTTTCGCGATATTCGTATACCTCATCCGGCAAAATTAGCTTCTGCTCCTCGTGAATTCGGCACCGCATTCGCCACTGGTTCCCCTCTCTCGATTCGGACACCAATCTACAGGAGAAAGGCTGCTCGCAGTTCAACATCAGTGTCTGTAAGATGTGAGCAGAGTACAAAAGGCAATGGTTTAGATGTATGGCTGGGACGACTCGCTATGGTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783055.1
MAAAVLSSSSLCCYASFRDIRIPHPAKLASAPREFGTAFATGSPLSIRTPIYRRKAARSSTSVSVRCEQSTKGNGLDVWLGRLAMVGFAAAISVEIATGKGLLEVCHVYQRFSSDLVSLSCCFNCNGDCEYGMVSSWMIVYYLWESAQ

XP_057783056.1
MAAAVLSSSSLCCYASFRDIRIPHPAKLASAPREFGTAFATGSPLSIRTPIYRRKAARSSTSVSVRCEQSTKGNGLDVWLGRLAMVGFAAAISVEIATGKGLLENFGLTEPLPTVALAVTALVGVLTAVFIFQSASDN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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