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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001456`

染色体: Chr08 坐标: 11720213-11722718 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001456`
名称	SmilChr08G001456
描述	arginine decarboxylase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11720213 - 11722718 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001003`
GeneID	`131001003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001003`
原始查询	`LOC131001003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arginine decarboxylase-like
产物	arginine decarboxylase-like
Arabidopsis	`AT4G34710` (ADC2) arginine decarboxylase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829623] identity=66.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0131300` (ADC1) - identity=65.3; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006527 (L-arginine catabolic process); GO:0008295 (spermidine biosynthetic process); GO:0008792 (arginine decarboxylase activity)
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02784 (Orn_Arg_deC_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783148.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783148.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783148.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783148.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11720468`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr8:11720468`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr8:11720547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C14,D6
`Chr8:11720581`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:11720581`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:11720746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C12,C15,C46
`Chr8:11720834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C12,C15,C46
`Chr8:11720934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,B9,C40
`Chr8:11720992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B29,B61,C3
`Chr8:11721004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C46
`Chr8:11721015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C33,D11
`Chr8:11721025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C10,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783148.1

657 aa

328

657

Orn_Arg_deC_N

PF02784 Orn_Arg_deC_N 116-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783148.1`	Pfam	`PF02784`	Orn_Arg_deC_N	Domain	116	369	1.2e-34	120.6	Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927165.1
ATGCGGCTTCGAGCATGGCTTCTCATACAAACTCCATAATAACGCCCGCAATATTTCCCTAATTTCTCTGTATACTCTCTCAAAATTTCAAACTGCTCTTGACTCGTTTCCGGCCGTTTTCCCTCCATTTATACAGTTAATTTTGATAATCATGGCAGCGATGTCGTGATTGAGATCCTTTGTTGCTTCTTCTGAGGGGGTAGCCGGGGCTCATCTGGCCTCGGCGGATTCTAAAGCCCCCATTTTTCTCTATAATGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001003
ATGGTGGAGGATAATCATAATGCTGATCCCTACGTTCTTCCCGCCGCCGCTGCATGGTCCCCGGCGCACTCGGCGATGCTGTACCGTGTGGACCGGTGGGGCGCCCCTTACTTCGCCGTGAACGCCGCCGGAAACATCTCCGTCCGCCCAAGTGGAGACGATACATTGCCCCACCACGAAATCGATCTTCTCAAGGTCGTGAGCATGGCCGCCGCCCCGAAATCTTCGGGCGGCCTCGGGCTTGAGCTCCCTCTGGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783148.1
MVEDNHNADPYVLPAAAAWSPAHSAMLYRVDRWGAPYFAVNAAGNISVRPSGDDTLPHHEIDLLKVVSMAAAPKSSGGLGLELPLVVRFPKLLQNRVEALQSAFGLAMESHGYDAHYQGVYPVKSNHDKYVVEDIVQFGSGFRFGLESGSKPELLLAMSCLCNGSPDALLVCNGFKDADYISLALVARKLHLNSVIVLEQEQELDLVIHIARKVLVRPVIGLRAKLRTKHAGHFGSTSGENGKFGLTTAQILRVVKKLGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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