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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001508`

染色体: Chr08 坐标: 12221183-12226013 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001508`
名称	SmilChr08G001508
描述	beta-galactosidase 13-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12221183 - 12226013 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001054`
GeneID	`131001054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001054`
原始查询	`LOC131001054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-galactosidase 13-like
产物	beta-galactosidase 13-like
Arabidopsis	`AT2G16730` (AT2G16730) glycosyl hydrolase family 35 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816174] identity=57.2; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0549200` (OsBgal10) - identity=50.8; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004565 (beta-galactosidase activity); GO:0005618 (cell wall); GO:0005773 (vacuole); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01301 (Glyco_hydro_35); PF02140 (SUEL_Lectin); PF02449 (Glyco_hydro_42); PF17834 (GHD); PF21467 (BetaGal_gal-bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057783214.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057783214.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783214.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783214.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12221667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:12221764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:12221929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D2
`Chr8:12222016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:12222426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:12223025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D11
`Chr8:12223064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B49,B53,C73,D6
`Chr8:12223449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:12223842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:12223976`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr8:12223976`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr8:12224096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783214.1

827 aa

414

827

Glyco_hydro_35

Glyco_hydro_42

GHD

BetaGal_gal-bd

SUEL_Lectin

PF01301 Glyco_hydro_35 36-342 aa PF02449 Glyco_hydro_42 58-199 aa PF17834 GHD 367-422 aa PF21467 BetaGal_gal-bd 621-687 aa PF02140 SUEL_Lectin 746-826 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783214.1`	Pfam	`PF01301`	Glyco_hydro_35	Domain	36	342	2.5e-114	382.9	Glycosyl hydrolases family 35
`XP_057783214.1`	Pfam	`PF02449`	Glyco_hydro_42	Domain	58	199	2.3e-08	34.5	Beta-galactosidase
`XP_057783214.1`	Pfam	`PF17834`	GHD	Domain	367	422	4e-20	72.0	Beta-sandwich domain in beta galactosidase
`XP_057783214.1`	Pfam	`PF21467`	BetaGal_gal-bd	Domain	621	687	1.9e-29	102.3	Beta-galactosidase, galactose-binding domain
`XP_057783214.1`	Pfam	`PF02140`	SUEL_Lectin	Domain	746	826	6.7e-14	52.7	D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927231.1
GCATTGTCCCATAATTTGCTCGAAATGCAAGAACATCCACAACCACATTTTAGCCAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAACCAAAGGCGCACATAAAATTCTATACCAAGTCAAGAAAAGTTGAAGAAGAAATCCGAGAAAAGCTCCGAGGTTGAATATGTGCCTTTCGTTGTGGTTGTACTAAAACATGTGCCTGCATTGCGCTCGTCTTTGTAGCTTCCTGGCACCTCGTCCCCATGTGGAAGAGGTTGCAAACTAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001054
ATGGTAGATCGAGGTAAATTGGTGTTTTGCGCTCTCTTGGCGTTGCTCGCTGCCAATGCCAATGCCAACGCCAACGAGGTAAAAGCTGTCTCCTACGATGGCCGCTCCATGATCATCAATGGCACCAGGCAATTGCTCTTCTCCGGTTCCATCCATTATCCACGCAGCACTCCTGAGATGTGGCCAAAGCTCATCCAGCAGGCTAAAGAAGGGGGTCTTAACCTGATCCAGACATATGTGTTCTGGAATATTCATGAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783214.1
MVDRGKLVFCALLALLAANANANANEVKAVSYDGRSMIINGTRQLLFSGSIHYPRSTPEMWPKLIQQAKEGGLNLIQTYVFWNIHEPVQGQFNFEGNYDLVKFIKMIGDNGLWVTLRLGPYIESEWNMGGFPYWLKEVPKIVFRTYNEPFMFHMKRYTEMIINMMKKEKLFADQGGPIIMAQIENEYNNVQLSYREDGEKYIKWAGDMAVGLYSGIPWIMCKQKNAPDTVISTCNGRHCADTFSGPNGPNKPSLWTENWT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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