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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001542`

染色体: Chr08 坐标: 12612343-12613042 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G001542`
名称	SmilChr08G001542
描述	uncharacterized protein At4g14450, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12612343 - 12613042 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001087`
GeneID	`131001087`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131001087`
原始查询	`LOC131001087`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839548]; symbol=AT1G04330; hit=AT1G04330; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839548]; symbol=AT1G04330; hit=AT1G04330; species=arabidopsis; confidence=low
拟南芥	`AT1G04330` (AT1G04330) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839548] identity=52.75; qcov=0.854; evalue=1.22e-17; confidence=low
水稻	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF30881 (At4g14450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001087

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G001542.1`
2	细胞质	1.00000	`SmilChr08G001542.1`
3	细胞质基质	0.40000	`SmilChr08G001542.1`
4	细胞质颗粒	0.20000	`SmilChr08G001542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12612487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B114,B29,B87,C38
`Chr8:12612506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B42,B43,B90,B92
`Chr8:12612511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B114,B29,B87,C38
`Chr8:12612619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	195	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr8:12612627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr8:12612635`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B103,B108,B94,C15,C29,C67
`Chr8:12612636`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	207	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B137,B138,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr8:12612645`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	46	A10,A11,A14,A18,A3,A7,B100,B115,B135,B138,B22,B27,B33,B35,B37,B47,B53,B60,B69,B76,B98,B99,C10,C11,C13,C32,C33,C34,C36,C38,C42,C45,C53,C56,C61,C62,C68,C69,C80,C82,C87,D1,D10,D3,D4,D9
`Chr8:12612706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60
`Chr8:12612706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:12612725`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A11,A18,A3,B100,B135,B138,B27,B53,B60,B98,B99,C11,C32,C34,C53,C61,C62,C68,C69,C80,C82,D1,D3,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G001542.1

来源蛋白: XP_057783274.1

103 aa

103

At4g14450

PF30881 At4g14450 5-90 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G001542.1` XP_057783274.1	Pfam	`PF30881`	At4g14450	Family	5	90	8e-29	100.9	Uncharacterized protein At4g14450, chloroplastic

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927291.1
TAATTAGTCATTAAATTTAGGTATAAAATACTTGTTTTACCAGCTCAACGTATTTGCGAATCCGAGGCAAGCCGAGTGAAATACGACAACATTTGACCCAGATCTGATTCTCTTCTGTTTCCAGCAAAGCGTGTGCACACCACGTGCCCCTTATTAATAACCCTACGCCCCCTCTCCCCTACTTAACATTCACACCTCTCTATTTCTGTTCTCCCCCCAAATCAAACCCCTAATCTTCAGTCTTCACGCACAAAAGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G001542.1 (XP_057783274.1)
ATGGAGAGCAGAAATCTCTCCGGCCGGCGGCAGCAGCTCAGCCGACTGCAGCGGAGGGCGCCGGCGTCCATTCAGATCAATCCGGTCACGGAGTGGAACGTGGCGATACCGCTTCTATCGCCGTTGGTTCAGTCGCCCAACAATCTGACGGCGGATATCAAGGCTTGTTCCAGTAGCGGAAAGGAGTCGGCGGCCGCGGAAAAGCCGGCTGCGGTGGTGATGAAGAAGTGGCAGCACCCCGCCGCGCCGTTCTGTTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G001542.1 (XP_057783274.1)
MESRNLSGRRQQLSRLQRRAPASIQINPVTEWNVAIPLLSPLVQSPNNLTADIKACSSSGKESAAAEKPAAVVMKKWQHPAAPFCYEPTPFLPFVCTGSSDRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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