Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001666`

染色体: Chr08 坐标: 13874269-13880912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G001666`
名称	SmilChr08G001666
描述	casein kinase 1-like protein 10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13874269 - 13880912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001211`
GeneID	`131001211`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131001211`
原始查询	`LOC131001211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	casein kinase 1-like protein 10
产物	casein kinase 1-like protein 10
拟南芥	`AT4G14340` (CKI1) casein kinase I [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827076] identity=76.57; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os02g0810400` - identity=75.11; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006897 (endocytosis); GO:0007165 (signal transduction); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF17667 (Pkinase_fungal)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001211

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	1.00000	`XP_057783514.1`
2	细胞质基质	1.00000	`XP_057783514.1`
3	细胞核	0.80000	`XP_057783514.1`
4	核质	0.40000	`XP_057783514.1`
5	细胞突起	0.20000	`XP_057783514.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13880438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C22,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783514.1

461 aa

230

461

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase_fungal

PF00069 Pkinase 10-227 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 10-269 aa PF17667 Pkinase_fungal 117-206 aa

XP_057783515.1

460 aa

230

460

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase_fungal

PF00069 Pkinase 10-227 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 10-269 aa PF17667 Pkinase_fungal 117-206 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057783514.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	10	227	2.2e-25	90.3	Protein kinase domain
`XP_057783514.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	10	269	2.2e-13	50.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057783514.1`	Pfam	`PF17667`	Pkinase_fungal	Domain	117	206	1.5e-08	34.5	Fungal protein kinase
`XP_057783515.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	10	227	2.2e-25	90.3	Protein kinase domain
`XP_057783515.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	10	269	2.2e-13	50.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057783515.1`	Pfam	`PF17667`	Pkinase_fungal	Domain	117	206	1.5e-08	34.5	Fungal protein kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927531.1
ACATCACAAACTAAAGGGAGAAAGAAAAAGGGCAAAAGAGAAAATTAAACTGCAGACACACAGATACACACATATAAATGTATATGTATATATACACACACACCCATATCTTGAACTGACATTCATGAGATATCCACAAATGTTATCAATCAGAGCAGTCTGAATTTGCTCTTCAATTCTTGTCTCTGTTCTTCTCTCACACGGATCTTTTCCAGAATCTATAAACTAAAATTTTCACCGCTACTTTTGTCTCCTTCAGA...

XM_057927532.1
AAGGGCAAAAGAGAAAATTAAACTGCAGACACACAGATACACACATATAAATGTATATGTATATATACACACACACCCATATCTTGAACTGACATTCATGAGATATCCACAAATGTTATCAATCAGAGCAGTCTGAATTTGCTCTTCAATTCTTGTCTCTGTTCTTCTCTCACACGGATCTTTTCCAGAATCTATAAACTAAAATTTTCACCGCTACTTTTGTCTCCTTCAGATTCTTCTTTCTCTCTCTTAGTTTCTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783514.1_42461
ATGGATCATGTCATCGGAGGGAAGTTTAAGCTGGGAAGAAAGATTGGCAGCGGATCTTTTGGAGAGCTTTACTTGGGAGTAAATATACAAACGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGCTGGAATCTGTTAAGACTAAGCACCCCCAGCTTCACTATGAATCAAAGTTGTACATGCTTCTTCAGGGGGGAACTGGGATTCCCCACCTTAAATGGTTTGGAGTTGAAGGAGAGTACAATGCCATGGCTATAGACCTTCTTGGGCC...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783515.1_42462
ATGGATCATGTCATCGGAGGGAAGTTTAAGCTGGGAAGAAAGATTGGCAGCGGATCTTTTGGAGAGCTTTACTTGGGAGTAAATATACAAACGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGCTGGAATCTGTTAAGACTAAGCACCCCCAGCTTCACTATGAATCAAAGTTGTACATGCTTCTTCAGGGGGGAACTGGGATTCCCCACCTTAAATGGTTTGGAGTTGAAGGAGAGTACAATGCCATGGCTATAGACCTTCTTGGGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783514.1
MDHVIGGKFKLGRKIGSGSFGELYLGVNIQTGEEVAVKLESVKTKHPQLHYESKLYMLLQGGTGIPHLKWFGVEGEYNAMAIDLLGPSLEDLFNYCNRKFSLKTVLMLADQLINRVEYMHSRGFLHRDIKPDNFLMGLGRKANQVYIIDYGLAKKYRDLQTHKHIPYRENKNLTGTARYASVNTHLGVEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYDRISEKKMLTPVEVLCKSYPSEFISYFHYCRSLRF...

XP_057783515.1
MDHVIGGKFKLGRKIGSGSFGELYLGVNIQTGEEVAVKLESVKTKHPQLHYESKLYMLLQGGTGIPHLKWFGVEGEYNAMAIDLLGPSLEDLFNYCNRKFSLKTVLMLADQLINRVEYMHSRGFLHRDIKPDNFLMGLGRKANQVYIIDYGLAKKYRDLQTHKHIPYRENKNLTGTARYASVNTHLGVEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYDRISEKKMLTPVEVLCKSYPSEFISYFHYCRSLRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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