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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004308`

染色体: Chr01 坐标: 61261478-61268096 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004308`
名称	SmilChr01G004308
描述	polygalacturonase inhibitor-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61261478 - 61268096 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001234`
GeneID	`131001234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001234`
原始查询	`LOC131001234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase inhibitor-like
产物	polygalacturonase inhibitor-like
Arabidopsis	`AT5G06860` (PGIP1) polygalacturonase inhibiting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830577] identity=50.5; qcov=0.942; evalue=2.39e-99; confidence=high
Rice	`Os05g0104600` (PGIP3) - identity=42.2; qcov=0.96; evalue=4.44e-73; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057783546.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057783546.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783546.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783546.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61261650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:61261717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C60
`Chr1:61261740`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr1:61261740`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B97
`Chr1:61261832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C50
`Chr1:61262123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:61262136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:61262203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C79,C87
`Chr1:61262282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,C1,C54,D7
`Chr1:61262288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:61262473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:61262527`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B27,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783546.1

326 aa

163

326

LRRNT_2

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 28-63 aa PF00560 LRR_1 116-138 aa PF00560 LRR_1 140-162 aa PF00560 LRR_1 192-209 aa PF00560 LRR_1 259-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783546.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	28	63	2.3e-09	38.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057783546.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	116	138	3.7e-20	68.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057783546.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	140	162	3.7e-20	68.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057783546.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	192	209	3.7e-20	68.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057783546.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	259	279	3.7e-20	68.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927563.1
TCAAAATATCCATAATCAAAACCCATGATTTCTTCCCATCTCTCTATTCTCTCTCTCCTCCTCTTGGGCTTGGCCTCCCTCTCAGAGACAGTCTCTGAGAAGTGCCACCCAAATGACAAGAAAGCCCTCCTCCAAATCAAGAAAGACCTCGACATCACCAATTGGAATCCCAAAACAGACTGCTGCCGAGACTGGTATGGCGTCAAGTGCGACGACAAGACCAACCGAATCATCGAATTTGTCCTCGCACAGGCCAACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001234
ATGATTTCTTCCCATCTCTCTATTCTCTCTCTCCTCCTCTTGGGCTTGGCCTCCCTCTCAGAGACAGTCTCTGAGAAGTGCCACCCAAATGACAAGAAAGCCCTCCTCCAAATCAAGAAAGACCTCGACATCACCAATTGGAATCCCAAAACAGACTGCTGCCGAGACTGGTATGGCGTCAAGTGCGACGACAAGACCAACCGAATCATCGAATTTGTCCTCGCACAGGCCAACCTCCACCTCCCGATTCCGACCGCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783546.1
MISSHLSILSLLLLGLASLSETVSEKCHPNDKKALLQIKKDLDITNWNPKTDCCRDWYGVKCDDKTNRIIEFVLAQANLHLPIPTAIGDLPYLQDLAIHNCNATGQIPQAFSKLSHLNFLDLRQNLLTGPVPSFLGNLKKLTYIGLSRNSLTGSIPPSLSQLPELGGLLLDRNNLTGGIPESFGYFKVQDFYLYMSHNQLSGPIPRSLGYTNFSLLDVSRNKLEGDISFMFGKNKSLNTADFSRNLLQFDFSKVEFPGNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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