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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001708`

染色体: Chr08 坐标: 14294544-14297878 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001708`
名称	SmilChr08G001708
描述	haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein At2g33255
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14294544 - 14297878 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001252`
GeneID	`131001252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001252`
原始查询	`LOC131001252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein At2g33255
产物	haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein At2g33255
Arabidopsis	`AT2G33255` (AT2G33255) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817888] identity=70.7; qcov=0.827; evalue=1.75e-122; confidence=high
Rice	`Os02g0816100` - identity=69.8; qcov=0.765; evalue=1.45e-105; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00702 (Hydrolase); PF13242 (Hydrolase_like); PF13419 (HAD_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057783572.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057783573.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783572.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783572.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14295320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:14295402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B78,B8
`Chr8:14297397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783572.1

260 aa

130

260

Hydrolase

HAD_2

Hydrolase_like

PF00702 Hydrolase 58-223 aa PF13419 HAD_2 61-225 aa PF13242 Hydrolase_like 185-235 aa

XP_057783573.1

277 aa

138

277

Hydrolase

HAD_2

Hydrolase_like

PF00702 Hydrolase 58-223 aa PF13419 HAD_2 61-225 aa PF13242 Hydrolase_like 185-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783572.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	58	223	5.8e-19	70.0	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057783572.1`	Pfam	`PF13419`	HAD_2	Family	61	225	4.4e-15	56.9	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057783572.1`	Pfam	`PF13242`	Hydrolase_like	Domain	185	235	6.5e-08	33.1	HAD-hyrolase-like
`XP_057783573.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	58	223	7.2e-19	69.7	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057783573.1`	Pfam	`PF13419`	HAD_2	Family	61	225	5.1e-15	56.7	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057783573.1`	Pfam	`PF13242`	Hydrolase_like	Domain	185	256	3.7e-11	43.5	HAD-hyrolase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927590.1
GGCCAATCGCCAATGTCTTAGAGCCCAAAGAGTCCGATGGGATGCGGATGATGATCTAAGAAATGAGTAGTTACGAGTTAGTAGCCGGTCTAATCTTAGAAAAACAATTGAATGCTATCCCCCGTGAAATTTTGATGCATAATTGAGAAAACAAAAATAGTAAATAAGTTAAAAATGTGATCGAAGATGAAAGTGGATTGGAAGAAATGGAAAAAAAATAATGATGTTAATTGTGGATGGTAATTAGAGGTAGCGATAAT...

XM_057927589.1
CATAATTGAGAAAACAAAAATAGTAAATAAGTTAAAAATGTGATCGAAGATGAAAGTGGATTGGAAGAAATGGAAAAAAAATAATGATGTTAATTGTGGATGGTAATTAGAGGTAGCGATAATCTAGGTGGAGCGAGTGAGGGCAAGCTGTCCTCCATCATCGCCCACCTCCATATGTTTATGTTGTGCTCTCGACCTCTCCAATTCCTCATTCCCGGCAGGGCATTTTCGTCAATGACCTCCTCCTCCCTCACCCCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001252
ATGGTAATTAGAGGTAGCGATAATCTAGGTGGAGCGAGTGAGGGCAAGCTGTCCTCCATCATCGCCCACCTCCATATGTTTATGTTGTGCTCTCGACCTCTCCAATTCCTCATTCCCGGCAGGGCATTTTCGTCAATGACCTCCTCCTCCCTCACCCCCAACCCCAGGCTGCGCGGCCTCGTCTTCGACATGGACGGAACCCTAACGGTCCCCGTCATCGACTTCCCCGCCATGTACAGAGCCGTCCTCGGCGAACAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783572.1
MVIRGSDNLGGASEGKLSSIIAHLHMFMLCSRPLQFLIPGRAFSSMTSSSLTPNPRLRGLVFDMDGTLTVPVIDFPAMYRAVLGEQDYLRIKSQSPSGIDILHHIETWTPDKQKRAYEIITDFEKQGLDKLQIMPGAAELCEFLESNNIRRGLITRNVKDAVDLFHKRFGMTFSPALSREFRPYKPDPAPLLYICSNWDMQPNEVMMVGDSLKDDVACGKRAGAFACLLDETGSSQLKMLTWEVGTSVSYNSCLAMYRGY

XP_057783573.1
MVIRGSDNLGGASEGKLSSIIAHLHMFMLCSRPLQFLIPGRAFSSMTSSSLTPNPRLRGLVFDMDGTLTVPVIDFPAMYRAVLGEQDYLRIKSQSPSGIDILHHIETWTPDKQKRAYEIITDFEKQGLDKLQIMPGAAELCEFLESNNIRRGLITRNVKDAVDLFHKRFGMTFSPALSREFRPYKPDPAPLLYICSNWDMQPNEVMMVGDSLKDDVACGKRAGAFACLLDETGRYNAPEYQNVEFKPDYKVSSLFELQSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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