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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001881`

染色体: Chr08 坐标: 16335877-16341414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001881`
名称	SmilChr08G001881
描述	vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16335877 - 16341414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001417`
GeneID	`131001417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001417`
原始查询	`LOC131001417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B-like
产物	vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B-like
Arabidopsis	`AT1G16020` (AT1G16020) vacuolar fusion protein (DUF1712) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838172] identity=63.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0427300` (NP70) vacuolar fusion [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4345617] identity=60; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0035658 (Mon1-Ccz1 complex); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF19031 (Intu_longin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783786.1`
2	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057783786.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783786.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057783788.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057783788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16337059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr8:16337512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B24,B9,C4,C82
`Chr8:16338780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C37
`Chr8:16338781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:16339083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783786.1

524 aa

262

524

Intu_longin_1

PF19031 Intu_longin_1 16-124 aa

XP_057783787.1

524 aa

262

524

Intu_longin_1

PF19031 Intu_longin_1 16-124 aa

XP_057783788.1

511 aa

256

511

Intu_longin_1

PF19031 Intu_longin_1 16-124 aa

XP_057783789.1

511 aa

256

511

Intu_longin_1

PF19031 Intu_longin_1 16-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783786.1`	Pfam	`PF19031`	Intu_longin_1	Domain	16	124	6.9e-22	78.5	First Longin domain of INTU, CCZ1 and HPS4
`XP_057783787.1`	Pfam	`PF19031`	Intu_longin_1	Domain	16	124	6.9e-22	78.5	First Longin domain of INTU, CCZ1 and HPS4
`XP_057783788.1`	Pfam	`PF19031`	Intu_longin_1	Domain	16	124	6.3e-22	78.6	First Longin domain of INTU, CCZ1 and HPS4
`XP_057783789.1`	Pfam	`PF19031`	Intu_longin_1	Domain	16	124	6.3e-22	78.6	First Longin domain of INTU, CCZ1 and HPS4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927805.1
AATCCATTAGATTTTTTTTGGTTTGTTAGGTTTGAATGCATATTTACTATCAAATGAAATCACACATGATTTTTACATAGTACATCCTGTTGTATAGTAGTATTTAAGATCATTTAACACTACTCTAATTTCCTTCTGATTTTAGTGTGAATTACTTTAGAACTAAGCTCAAACCTTTATACTTTAGCTAAGAAAAAATGTTCATATTCGTGCCCAATCCCACAGTCCGGATACAAAGTCGGGTTTGAATCGGTTGACCC...

XM_057927803.1
TAGTGTGAATTACTTTAGAACTAAGCTCAAACCTTTATACTTTAGCTAAGAAAAAATGTTCATATTCGTGCCCAATCCCACAGTCCGGATACAAAGTCGGGTTTGAATCGGTTGACCCACTAACCCGCGTACATAATTTGCCGTTACCGCCGTCTAACCGCCGTTAATCTCCAAGCCCAGCAACCGGCACGACGAGCTACTTATTTGCATCGTCACTCGCCCGTTGACGGAACCCCGGCGCCGCCGCCTTCAATCGGCAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131001417
ATGGGCCTAACATCTGAGAGTGATGCGAAGGAAGGAATGAAATTATGTATGTTTGATTTGAGGAGGGGCCAAACGGAAGGGCAGGAGTTGGACAAGATTCTCTTCTTCTATCCTGCCGATTTGCCCCTTACGACTCAGCTGTCGGTTATTGGCCTCAGCGAAGGATTGATTACTTTTACCAGAATTTTCTCTCCAGATGCTCCTTGTGAGGTGATTGAAGCTGAGAAGCATTGTCATGTTTTTTATGAAGCAGAGCCAGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057783786.1
MGLTSESDAKEGMKLCMFDLRRGQTEGQELDKILFFYPADLPLTTQLSVIGLSEGLITFTRIFSPDAPCEVIEAEKHCHVFYEAEPDIWMVLVVGKENSEAIWRVDSLRNVLKEVHSLFMMFHGYIRALVDKEPSGGLVRSHLYYFIMDFLSAFEKRSPLEYCCWDFSIGKKLQLPNFRDSLKEQGTLQMLTVGREAAIEVQSLVTVLESCVGNTQCYSMTMFQDLLVSTNLSPIDTLNLFTYAVLRLTPLALFHGASSW...

XP_057783787.1
MGLTSESDAKEGMKLCMFDLRRGQTEGQELDKILFFYPADLPLTTQLSVIGLSEGLITFTRIFSPDAPCEVIEAEKHCHVFYEAEPDIWMVLVVGKENSEAIWRVDSLRNVLKEVHSLFMMFHGYIRALVDKEPSGGLVRSHLYYFIMDFLSAFEKRSPLEYCCWDFSIGKKLQLPNFRDSLKEQGTLQMLTVGREAAIEVQSLVTVLESCVGNTQCYSMTMFQDLLVSTNLSPIDTLNLFTYAVLRLTPLALFHGASSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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