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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002295`

染色体: Chr08 坐标: 21438799-21450256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002295`
名称	SmilChr08G002295
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 16
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21438799 - 21450256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001822`
GeneID	`131001822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001822`
原始查询	`LOC131001822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 16
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 16
Arabidopsis	`AT4G34910` (AT4G34910) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829643] identity=67.9; qcov=0.947; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0728800` (OsRH16) - identity=64; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784403.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057784403.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784403.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784403.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21439450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C59
`Chr8:21439455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr8:21441755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:21442274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:21442276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:21443271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C16
`Chr8:21448670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:21449731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:21449767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,D11
`Chr8:21450020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C59
`Chr8:21450091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784403.1

606 aa

303

606

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 61-237 aa PF04851 ResIII 74-230 aa PF00271 Helicase_C 282-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784403.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	61	237	2.4e-39	135.5	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057784403.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	74	230	8.2e-08	33.1	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057784403.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	282	418	1.5e-21	77.4	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928420.1
AAGGAAAAAGAGAAGAAAAAAAAGCGAAGTCAGTCCAACCCGGTCCGATAATTCTGAAACAAAAACCTCTGAAAAACCCTAATCCACATCGTCGTCACCTGCAACGCGCCTTTCACTCGAAAACTCCCAGCATCAATGGCGAAAAGAAAACGCAATCCCCAAAACGACAGCGTAAATGAGAAGAAGGAACAAGAAAAAGCGGTTGTTGCAGGAGAAGTAGAAGAAGAACAGGATGACGACGAGCGGAGCTTCGAAGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001822
ATGGCGAAAAGAAAACGCAATCCCCAAAACGACAGCGTAAATGAGAAGAAGGAACAAGAAAAAGCGGTTGTTGCAGGAGAAGTAGAAGAAGAACAGGATGACGACGAGCGGAGCTTCGAAGAATTGGGCCTCGACGCCCGCCTAGTTCGTGCCTTATCGAAGAAATCAATCGAGAAGCCCTCTCCAATCCAGCGCGTTGCTATCCCTCTCATTCTCGAAGGCAAAGATGTGGTGGCTCGAGCGAAAACCGGCTCCGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784403.1
MAKRKRNPQNDSVNEKKEQEKAVVAGEVEEEQDDDERSFEELGLDARLVRALSKKSIEKPSPIQRVAIPLILEGKDVVARAKTGSGKTLAYLLPLLQKLFADSPSKLNLAPAVIILVPTRELCQQVYSEVTSLIESCRVQLKVVQLRSTMSDSDLKTSLAGLPDIVVSTPACVQTCLKNGILQAKALQESLSVLVLDEADLLLSYGYEDDIKALTAYVPKRCQCLLMSATSSADVEKLKKLILHNPYILTLPEVGDVKDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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