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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002414`

染色体: Chr08 坐标: 22927842-22931324 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002414`
名称	SmilChr08G002414
描述	leucine aminopeptidase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22927842 - 22931324 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001934`
GeneID	`131001934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001934`
原始查询	`LOC131001934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine aminopeptidase
产物	leucine aminopeptidase
Arabidopsis	`AT5G13520` (AT5G13520) peptidase M1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831196] identity=72; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0819100` (LKHA4) - identity=71.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008237 (metallopeptidase activity); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil00590 (Arachidonic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01433 (Peptidase_M1); PF09127 (Leuk-A4-hydro_C); PF17900 (Peptidase_M1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784564.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784564.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057784564.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784564.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784564.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22928082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:22928128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B132,B45,B68
`Chr8:22928317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22928350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:22930456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:22930579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22930882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr8:22930894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:22930989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784564.1

613 aa

306

613

Peptidase_M1_N

Peptidase_M1

Leuk-A4-hydro_C

PF17900 Peptidase_M1_N 120-163 aa PF01433 Peptidase_M1 251-439 aa PF09127 Leuk-A4-hydro_C 495-608 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784564.1`	Pfam	`PF17900`	Peptidase_M1_N	Domain	120	163	4.4e-09	37.4	Peptidase M1 N-terminal domain
`XP_057784564.1`	Pfam	`PF01433`	Peptidase_M1	Domain	251	439	2.9e-42	145.4	Peptidase family M1 domain
`XP_057784564.1`	Pfam	`PF09127`	Leuk-A4-hydro_C	Repeat	495	608	1.1e-27	97.0	Leukotriene A4 hydrolase, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928581.1
CAGCCTAATATTATATGCAAAGTAAAGCATATAATTGCACAAGAAATTGGCCCCTTTAATCTCTTTTTGTCTTTATTCCCAAAATCTTGTCTCCCTCCAAATTTTTTAAACCCTAATTTTATTTAGTGCGCTTTCTGCTCGAATTCCCTTTTCCATTTTTCTCCTCCACCGCTTCTCCACCGCCGTCCGCCGTCGTCATTCTCATCAAGATGGCTCCAATCGACCCCCACTCCTACACTGACTCCAGCCACCCCCTCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001934
ATGGCTCCAATCGACCCCCACTCCTACACTGACTCCAGCCACCCCCTCACCACCCACATCTCCCTCTCTTTCTATTTCGATTTCCCCTCCTCCACCATCGCCTCCTCCGCCCTCCTCTCCCTTTCCGCCCCCCACTCCGGCCCACTCACACTCGACACCCGCTCCCTCTCCATCTCCGCCGTGATCGACCCCGTCACCGGCGCTCCCCTCCCCTTCACGCTCGACCCCCCTTCCCCCGACGCCGTTTTGGGGCAATCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784564.1
MAPIDPHSYTDSSHPLTTHISLSFYFDFPSSTIASSALLSLSAPHSGPLTLDTRSLSISAVIDPVTGAPLPFTLDPPSPDAVLGQSLVVTLSNQSQLLLLSKTTPSSSALQWLSPPQTFNKSYPFVFTQCQAIHARSIFPCQDTPAARIKFAAKLNIPRYLSAVMSAKHVNRRDPAAGECGGACDDALWCAEGRVVEEFVMEQPVPPYLFAFAVGELGFREVGPRTKVYSEAVPAVLDAAAREFAGSEEMIKVGEALFGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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