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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004929`

染色体: Chr01 坐标: 67358442-67364228 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004929`
名称	SmilChr01G004929
描述	vacuolar-sorting receptor 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67358442 - 67364228 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005270`
GeneID	`131005270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005270`
原始查询	`LOC131005270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar-sorting receptor 3-like
产物	vacuolar-sorting receptor 3-like
Arabidopsis	`AT2G14740` (VSR3) vacuolar sorting receptor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815962] identity=79.2; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0346600` - identity=76; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF12662 (cEGF); PF25011 (VSR_TRX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057788138.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057788138.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057788138.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057788138.1`
5	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057788138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67359037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:67359054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C87
`Chr1:67359081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:67359281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:67359984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B8
`Chr1:67360098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:67360427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B50
`Chr1:67360427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:67360819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67360959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C87
`Chr1:67360965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:67362409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788138.1

630 aa

315

630

VSR_TRX

cEGF

PF02225 PA 64-166 aa PF25011 VSR_TRX 193-400 aa PF12662 cEGF 502-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788138.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	64	166	1.4e-16	61.1	PA domain
`XP_057788138.1`	Pfam	`PF25011`	VSR_TRX	Domain	193	400	4.8e-103	344.0	Vacuolar sorting receptor thioredoxin-like domain
`XP_057788138.1`	Pfam	`PF12662`	cEGF	Domain	502	522	1.6e-07	31.8	Complement Clr-like EGF-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932155.1
ATGAGAAAAATCAATAATTATGTAAAGTGTTGTAAAATAGTACAATAATCAACATTAATTGTAAACAAATGCTATTTTGATTTATTTTTTGAACTTAAATATTCGATTTTTTTCTTTCAGAATTGAAGGCAGGATAGAAACTTAGATTACTAACAGTAACAGTATCTTTATCACTGGATTAAACTTTGTTTTAGATAAATATTTAGATTAAACACAAAAAGCTATCGTATTCGTGTAGTTTTTATATCGGATGCAGACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005270
ATGGGGCGTTGTGGAAGATTGAAAGCTGCAATCTTGCTGCCTTTTCTAGTGCTGATTTGGGCGGAATTAGTGGTGGGTCGGTTTCAGGTGGAGAAGAACAGTCTGAGAGTGTTATCGCCGGAAAGCATTAGGGGAAATCACGATAGTGCCATCGGCAACTTTGGGCTTCCACAATATGGTGGAAGCATGGCTGGAACTGTGGTGTATCCAAAGGATAATAGAAAGGGCTGCCATAAATTTGATGATTCTGGGATTTCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788138.1
MGRCGRLKAAILLPFLVLIWAELVVGRFQVEKNSLRVLSPESIRGNHDSAIGNFGLPQYGGSMAGTVVYPKDNRKGCHKFDDSGISFKTKPGGLPTFVLVDRGDCFFALKVWNAQNAGAAAVLVADHLDEPLITMDSPEEDRASAEYIANITIPSALIDKSFGEKLKKALSKGDMVNVNLDWREAVPHPDDRVEYELWTNSNDECGVKCDMLMEFLKDFKGAALMLEQGGYTQFTPHYITWYCPEAFTVSKQCKSQCLNH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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