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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004965`

染色体: Chr01 坐标: 67742964-67745348 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004965`
名称	SmilChr01G004965
描述	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	67742964 - 67745348 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005304`
GeneID	`131005304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005304`
原始查询	`LOC131005304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
产物	probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.1
Arabidopsis	`AT2G14960` (GH3.1) Auxin-responsive GH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815985] identity=80; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0592600` (GH3-8) - identity=75.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016881 (acid-amino acid ligase activity)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03321 (GH3); PF23571 (GH3_M); PF23572 (GH3_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788186.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788186.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788186.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057788186.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:67743422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B66
`Chr1:67743494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:67743539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:67743591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B94,C38,C71
`Chr1:67743596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:67743638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B140,B94,C38,C71
`Chr1:67743848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B66,C8
`Chr1:67743884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B54
`Chr1:67743998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:67744037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:67744166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B66,C8
`Chr1:67744186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B115,B20,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788186.1

592 aa

296

592

GH3

GH3_M

GH3_C

PF03321 GH3 23-330 aa PF23571 GH3_M 358-432 aa PF23572 GH3_C 448-563 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788186.1`	Pfam	`PF03321`	GH3	Domain	23	330	2.9e-122	408.3	GH3 family N-terminal domain
`XP_057788186.1`	Pfam	`PF23571`	GH3_M	Domain	358	432	1.6e-31	108.8	GH3 family central domain
`XP_057788186.1`	Pfam	`PF23572`	GH3_C	Domain	448	563	1.8e-38	132.6	GH3 family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932203.1
AACTGCACGTTTTTTTGCCCAGGTGACGTGGCATGTGACGTGGCGCCCTTGTTCCCCCTATATATATCCGCTCCCCTTCCTCCCTGCTCTTCACCATCATCTCTCCTTCACAAAATTACTTGTTCTACTAATATTCTATTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACAAAACACAAACTTTCTCTCTCTAGAAATCAAATCATTTGCAGTTCTCGTAGAAATGGCGGTTGACTCGATTCTGTCGTCTCCATTGGGCCCTCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005304
ATGGCGGTTGACTCGATTCTGTCGTCTCCATTGGGCCCTCCGGCATGCGAAAAGGACGCAAAGGCCCTTCAATTCATCGAGGAGATGACCCGCAACGCTGACTCCGTTCAGGAAAATGTGCTGGCGCAAATCCTTGCCCGCAATGCCCAGACCGAGTATCTAAAGAGCTTCAATCTCGACGGAGCCACGGATCGTCACACCTTCAAATCCAAAATCCCCATGGTCACCTATGAAGACCTCCAGCCCTTGATCCAGAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788186.1
MAVDSILSSPLGPPACEKDAKALQFIEEMTRNADSVQENVLAQILARNAQTEYLKSFNLDGATDRHTFKSKIPMVTYEDLQPLIQRIANGDRSPILSSHPVSEFLTSSGTSAGERKLMPTIKEELDRRQLLYSLLMPVMNLYVNGLDKGKGLYFLFIKSETKTPGGLLARPVLTSYYKSDHFKTRPHDPYNIYTSPNEAILCPDSFQSMYTQMLCGLYDRHQVLRVGAVFASGLLRAIRFLQLNWQQLADDIRAGSLNPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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