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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005022`

染色体: Chr01 坐标: 68197204-68200959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005022`
名称	SmilChr01G005022
描述	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68197204 - 68200959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005386`
GeneID	`131005386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005386`
原始查询	`LOC131005386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase, chloroplastic-like
产物	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G34350` (HDR) 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829585] identity=71.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0731900` (OsHDR) - identity=76.4; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0019288 (isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway); GO:0046872 (metal ion binding); GO:0050992 (dimethylallyl diphosphate biosynthetic process); GO:0051745 (4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase activity)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02401 (LYTB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788325.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057788325.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788325.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788325.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68197490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C43
`Chr1:68197639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:68197666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B49,C59
`Chr1:68197832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C19,C31
`Chr1:68197854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:68197929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B4,B54,C27
`Chr1:68197944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:68197986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B41,C17,C40,C86
`Chr1:68198252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:68198587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C47
`Chr1:68198596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B4,C27
`Chr1:68198611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C3,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788325.1

462 aa

231

462

LYTB

PF02401 LYTB 109-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788325.1`	Pfam	`PF02401`	LYTB	Family	109	450	3.9e-79	266.4	LytB protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932342.1
AGAATCGTTTCGTCTTCCCCACACCATCCCGCCGCCCACCCACCAACCAACTGCCACCCCCTCCACCCAGGCCAGGGCCCTCCACCCCCACAAATTTCCTTCGACTCCCTCTTCCCATCCCCTCCGCCGTCCCCATCTCACCCCGCCCTCCAATTTCCCAGCCTGCCGACCCCTCCACATTTCCACCCCCACATCTAATTTCTCAGCCCGCCGTCCCTCCGCTCTTCACCCGTTTTCCTTTTTCTTTGTGAGTATAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005386
ATGGCGATCTCTCTTCAATTTTGCCGCATCTCAACGCCAACCGAGCTCCCGGTGCCAGAGACCAGGCTTTTCCGGCGGCGGAGGCCTTCCTCTCTGCGGTGCGCCGCCGACGGAGATGGTGCCTCGTCGTCGGCCGTCGCCACTGACCCTGCCGAGTTTGATGCGCATGCTTTCCGTCGCAACTTGACGAGGAGTAAGAATTACAATCGGAAGGGGTTTGGGCTTAAAGAGGAGACGCTCAAGCAAATGAGCGAAGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788325.1
MAISLQFCRISTPTELPVPETRLFRRRRPSSLRCAADGDGASSSAVATDPAEFDAHAFRRNLTRSKNYNRKGFGLKEETLKQMSEEFTSDIIKKLKENENEYTWGNVTVKLAESYGFCWGVERAIQIAFEARRQFPSDNMWLTNEMIHNPTVNKMLEDMEVQTIPVNEGKKEFEVVSEGDVVVLPAFGAAVDEMRILSEKNVQIVDTTCPWVSKVWNTVDKHKKKDYTSIIHGKYNHEETVATASFARKYIIVKNIKEAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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