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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005430`

染色体: Chr01 坐标: 71464347-71469008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005430`
名称	SmilChr01G005430
描述	amidase 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71464347 - 71469008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005758`
GeneID	`131005758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005758`
原始查询	`LOC131005758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amidase 1
产物	amidase 1
Arabidopsis	`AT1G08980` (AMI1) amidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837418] identity=65.1; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0118100` (OsAMI1) - identity=57.7; qcov=0.981; evalue=7.46e-164; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01425 (Amidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788804.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788804.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057788804.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057788804.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057788804.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71464627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B71,B80,C87
`Chr1:71465295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D10
`Chr1:71465325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B1,B11
`Chr1:71465655`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr1:71465655`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr1:71466290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71466313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:71466442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71466671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B46,B68,C8
`Chr1:71467948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C20
`Chr1:71467969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C82,D7
`Chr1:71468035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788804.1

426 aa

213

426

Amidase

PF01425 Amidase 24-179 aa PF01425 Amidase 327-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788804.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	24	179	4e-61	208.1	Amidase
`XP_057788804.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	327	413	4e-61	208.1	Amidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932821.1
AATTCGAGATTTATTTTTTATTCATGAATTGTGTAGTTTTGTAAAATAAGTGACGTTTTCATTCATGAGATGTGTATTTTTTTTCGTGGCTGATTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATAGCGTGAAAAAATAAAAGTTTTATAAAATAGCGTGAAAAAATACAGTATTGTGCACAAAATATATATTAATCCAAATAAGAAATCATTTTGTGTGTCTACATAGAGAGAGAATGTCGAGAAGCTTATCATCAGATTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005758
ATGTCGAGAAGCTTATCATCAGATTATGGGGCGTTCATGGAGAAATTCACTCTGCTTCCTCACTCTTCTTCTCATGAGCTTCCCCTAACTTCCCTTACATTTGCTGTCAAAGACATATTCGACGTGGAGGGTTATGTCACGGGTTTTGGGAACCCGGACTGGGCGAGGACACACTCGGCTGCCACGACGACTGCCCCGGCCGTGCTGTCGATGCTCAAGGCAGGTGCAACATGTGTTGGCAAAACCGTGATGGATGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788804.1
MSRSLSSDYGAFMEKFTLLPHSSSHELPLTSLTFAVKDIFDVEGYVTGFGNPDWARTHSAATTTAPAVLSMLKAGATCVGKTVMDEMAYSINGENVHYGTPRNPCAADRVPGGSSSGSAVAVGASLADFSLGTDTGGSVRVPASYCGIYGFRPSHDLVSTSGVTPMAQSFDTVGWFARDPVILKKVGKVLLQLRDDNPATLGQLIVAQDCFDLVNIPPRQLKDVLTTSVEKLYGSKIIQYTNLGEFVESKLPNLKVFMNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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