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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005506`

染色体: Chr01 坐标: 71920209-71927452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005506`
名称	SmilChr01G005506
描述	peroxisomal nicotinamide adenine dinucleotide carrier
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71920209 - 71927452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005842`
GeneID	`131005842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005842`
原始查询	`LOC131005842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisomal nicotinamide adenine dinucleotide carrier
产物	peroxisomal nicotinamide adenine dinucleotide carrier
Arabidopsis	`AT2G39970` (PXN) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818584] identity=74.8; qcov=0.979; evalue=1.72e-165; confidence=high
Rice	`Os03g0265300` (OJ1012B02.12) - identity=69.6; qcov=1.01; evalue=1.88e-156; confidence=high
GO	GO:0006862 (nucleotide transport); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057788926.1`
2	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.80000	`XP_057788926.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057788926.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057788926.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71921053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B98,C51,C65
`Chr1:71922869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:71923618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B70,B81,C74
`Chr1:71924966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B94,C22,C41
`Chr1:71924997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:71925149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B72,B98,C51,C65
`Chr1:71927174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:71927175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:71927177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B58,C20,C4,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788926.1

337 aa

168

337

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 6-90 aa PF00153 Mito_carr 110-217 aa PF00153 Mito_carr 229-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788926.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	6	90	3.9e-58	193.9	Mitochondrial carrier protein
`XP_057788926.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	110	217	3.9e-58	193.9	Mitochondrial carrier protein
`XP_057788926.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	229	317	3.9e-58	193.9	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932943.1
AATATTCTTCAAATTTATATGTAGTTATTTTATTTTGCTTCTATTTATTATTCCACCTCACATTCACAAACATATAAAAAAAAGGTTTTTAGATGCTTCAAATTAAAAAGCACTAAAAGAAGGCTAATCCCATTTGAAACTAATTGAAATTTAAAATCCTCTATAAACCCTGAGAAGAAAGGGCCTAATCCATATCCTAATCTCAGTCTTCAAGTATGATATTGGTATTGATTTTGATGTTGTAGGGAAGGACGCAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005842
ATGTCCGACGCTTTGATCAACGGCCTCGCCGGTGCCGGCGGTGGAATTATCGCTCAGCTCATTACGTATCCTCTCCAAACGGTAAATACTCGGCAGCAAACAGAGAGGGATCCGAAGAAGGAGAGGAGGAAAATTGGGACTTTGGAGCAAATGTATCAGGTCGTAAAGCAAGAAGGGTGGGATCGGCTGTATGGAGGATTAGCTCCGTCTCTCGTCGGCACTGCTACGTCTCAGGGTGTTTACTATTATTTCTATCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788926.1
MSDALINGLAGAGGGIIAQLITYPLQTVNTRQQTERDPKKERRKIGTLEQMYQVVKQEGWDRLYGGLAPSLVGTATSQGVYYYFYQIFRNKAEVAALERKRKGFGDGSVGMLSSLVVAAMAGCVNVLLTNPIWVVVTRMQTHTKKSQPNRTGLLSSDDIIPSAVEPPPFGTTLAIQEVYGEGGVLGFWRGVFPTLIMVSNPSIQFMLYETLLKRLKKRRLSSSKGNSNVTALEIFLLGALAKLGATVVTYPLLVVKSRLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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