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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005515`

染色体: Chr01 坐标: 71975466-71980582 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005515`
名称	SmilChr01G005515
描述	laccase-22-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71975466 - 71980582 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005852`
GeneID	`131005852`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005852`
原始查询	`LOC131005852`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-22-like
产物	laccase-22-like
Arabidopsis	`AT2G38080` (IRX12) Laccase/Diphenol oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818386] identity=64.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0634500` (OsLAC2) - identity=61.2; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005852

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788937.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788937.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788937.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788937.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71975833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:71976779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:71976810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:71976933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:71976938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71976962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:71976996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B63,C78,D4
`Chr1:71977142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:71977149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C40,C50
`Chr1:71977152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71977160`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A1,A20,B112,B115,B120,B134,B136,B138,B18,B37,B55,B62,B74,B93,C12,C21,C23,C35,C39,C54,C86,D3
`Chr1:71977164`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A1,A20,B112,B115,B120,B134,B136,B138,B18,B37,B55,B62,B74,B93,C12,C21,C23,C35,C39,C54,C86,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788937.1

558 aa

279

558

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 34-147 aa PF00394 Cu-oxidase 161-309 aa PF07731 Cu-oxidase_2 409-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788937.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	34	147	1.3e-43	148.6	Multicopper oxidase
`XP_057788937.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	161	309	2.1e-45	155.3	Multicopper oxidase
`XP_057788937.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	409	541	9e-46	155.8	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932954.1
CTCTGCCTCATTATACTCTCTATCCCAAAACAGAGACTTTACACACAAACAACAGATAATGGGGGGGAAAGTTGGCGTCGCTCTAGCTCTCATGCTCCTCACACTCTTCTCCTCTTCGTCGCGTGTTGACTCGAGAATCCGACACTATAAGTTCACGGTGGTGAGGAAGAACACGACGAGGCTGTGTGCGAGCAAGCCCATCATCACGGTGAACGGAAAATTCCCGGGGCCCACTCTCTATGCACGGGAAGATGATACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005852
ATGGGGGGGAAAGTTGGCGTCGCTCTAGCTCTCATGCTCCTCACACTCTTCTCCTCTTCGTCGCGTGTTGACTCGAGAATCCGACACTATAAGTTCACGGTGGTGAGGAAGAACACGACGAGGCTGTGTGCGAGCAAGCCCATCATCACGGTGAACGGAAAATTCCCGGGGCCCACTCTCTATGCACGGGAAGATGATACAGTCATTGTTAGAGTTGTGAACCATGTCACAGACAATGTCACAATACACTGGCACGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788937.1
MGGKVGVALALMLLTLFSSSSRVDSRIRHYKFTVVRKNTTRLCASKPIITVNGKFPGPTLYAREDDTVIVRVVNHVTDNVTIHWHGVRQLRTGWADGPAYITQCPIQTGQSYIYKFTLTGQRGTLLWHAHINWQRATVHGAIVILPRLGVPYPFPEPHKEEIIILGEWWKADVEAVINQAMQAGLPPNVSDAHTINGLPGPSPNCSYAGYSLHVESGKTYLLRIINAAVNEELFFKIAGHHLTVVEVDAAYTKPFKTDTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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