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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005530`

染色体: Chr01 坐标: 72157631-72160679 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005530`
名称	SmilChr01G005530
描述	uncharacterized SmilChr01G005530
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72157631 - 72160679 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005992`
GeneID	`131005992`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005992`
原始查询	`LOC131005992`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468]; symbol=AT5G05830; hit=AT5G05830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468]; symbol=AT5G05830; hit=AT5G05830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05830` (AT5G05830) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468] identity=66.7; qcov=0.786; evalue=1.75e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0850200` (OsRFPV-3) - identity=62.9; qcov=0.757; evalue=1.32e-64; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005992

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789127.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789127.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789127.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789127.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72158060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C3
`Chr1:72158148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B20
`Chr1:72158160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B16,B17
`Chr1:72158173`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A13,A18,A19,A22,A3,A5,B109,B11,B110,B114,B122,B124,B133,B14,B21,B22,B23,B24,B25,B45,B46,B58,B6,B63,B65,B68,B69,B74,B78,B79,B85,B91,B96,B97,C16,C17,C2,C20,C3,C30,C35,C36,C38,C40,C42,C45,C46,C49,C51,C52,C56,C59,C60,C64,C66,C71,C77,C79,C82,C83,C84,D3,D4,D5,D6
`Chr1:72158183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C60
`Chr1:72159800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A18,B109,B123,B134,B14,B19,B84,C13,C28,C38,C56
`Chr1:72159840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B2
`Chr1:72159867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:72159909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B58,C2,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789127.1

210 aa

105

210

RINGv

PF12906 RINGv 85-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789127.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	85	136	5.3e-10	40.0	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933144.1
CAAGGTCACTTTTCTTTTCCATTAAAATCCAACATATGCAAATCACATGTCCAATTACGTGTACACACAAATATGTCATCAAATTTCACATGTCTGCGGTAGCTGTAAGATACTTTTTGTGAGCAATTTATGTCGAATTTTTTTGGATAAAAGCTTTGCAAAATATCCCAGCAAAAAAGAGGGCGAGAGGCCAATGGTTATCCCCGCCACCGACGCTCCTGTTTCACTTGGTGCAGCGTTTGTTTTTTATTTTTCTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005992
ATGTCATCTTTACGGCAATCGAGTGATGTTGATTTGGAATCAGGCGGTGGCGGTGGTGGTCCGGCGGAAGTAGACGCCGGGAGAGGAGGTGGTGCTGCGCCTGCGCCGCCCTCTAATGGAAATGAGATTGTGAATGTGAAGGATAAGGTTGAGAGGAGGGATTCAAATGTTTCAGAGTATTCAGTGGAGATGGTGGATCTGGAATCTGGTGCAGATGAATCTAAGCTGCATTTGGCAAGAAATGTGAAGGATTGTAGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789127.1
MSSLRQSSDVDLESGGGGGGPAEVDAGRGGGAAPAPPSNGNEIVNVKDKVERRDSNVSEYSVEMVDLESGADESKLHLARNVKDCRICHLSMDATNQESGIPIELGCSCKDDLAASHKQCAEAWFKIKGNKICEICGSIAQNVVGIDEAELMEQWNETNEADAASASATTRAPLLESRNFWQGHRFLNFLLACMVFAFVISWLFHFNVPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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