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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005674`

染色体: Chr01 坐标: 73018264-73019041 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005674`
名称	SmilChr01G005674
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73018264 - 73019041 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006000`
GeneID	`131006000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006000`
原始查询	`LOC131006000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT4G00905` (AT4G00905) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827986] identity=41.9; qcov=1.06; evalue=1.32e-41; confidence=medium
Rice	`Os09g0526800` (OJ1439_F07.19-1) - identity=43.6; qcov=0.994; evalue=7.08e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789135.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789135.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057789135.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789135.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73018403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C52
`Chr1:73018626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C33,D4
`Chr1:73018640`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,B64
`Chr1:73018640`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B64
`Chr1:73018644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C18,C57
`Chr1:73018650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:73018675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B64
`Chr1:73018690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B81,C10,C35,C40,C79
`Chr1:73018693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C10,C35,C40,C49,C79
`Chr1:73018741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B9
`Chr1:73018749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C71
`Chr1:73018750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789135.1

180 aa

180

LRAT

PF04970 LRAT 13-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789135.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	13	151	3.4e-25	89.4	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933152.1
GGAAAGGTCGAGACCATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGCCGAGACCATTGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAAGAAAGGTAGCTGTAAAATATGGGTTTGGCTTCAAATTACATCGCCCGCCGCTACATTAAGCCCGGCGACCACCTTTACGTCTACCGAGCATGTCTCGCCTATTCACATCATGGTATCTACCGTAGCGAAGGGCAAGTGATTCACTTCACGAGTGCAGCATCGTCTTCGGCTGAACGAAGGGAGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006000
ATGGGTTTGGCTTCAAATTACATCGCCCGCCGCTACATTAAGCCCGGCGACCACCTTTACGTCTACCGAGCATGTCTCGCCTATTCACATCATGGTATCTACCGTAGCGAAGGGCAAGTGATTCACTTCACGAGTGCAGCATCGTCTTCGGCTGAACGAAGGGAGGTTTGCTCGGCGTGTGAGTTAATGGAGTATAGTGAGCGCAGCAGTGGGGTGATCGCGTCTTGCCTGGATTGCTTCCTGAAATCGGGGTCGCCGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789135.1
MGLASNYIARRYIKPGDHLYVYRACLAYSHHGIYRSEGQVIHFTSAASSSAERREVCSACELMEYSERSSGVIASCLDCFLKSGSPRRYKYGVTKAGYLMRRRGTCNTAEAGPVEVVLERAESLLSRNGFGEYNLLTNNCEDFATFCATGQKCNRNGTTRTYGQASLLGGFAFRRCHPNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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