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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005594`

染色体: Chr01 坐标: 72573853-72574621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005594`
名称	SmilChr01G005594
描述	17.3 kDa class I heat shock protein-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72573853 - 72574621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006015`
GeneID	`131006015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006015`
原始查询	`LOC131006015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	17.3 kDa class I heat shock protein-like
产物	17.3 kDa class I heat shock protein-like
Arabidopsis	`AT1G53540` (AT1G53540) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841789] identity=72.2; qcov=1.03; evalue=8.63e-78; confidence=high
Rice	`Os03g0267200` (OsHsp17.7) - identity=67.5; qcov=1.08; evalue=8.48e-73; confidence=high
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0009408 (response to heat); GO:0009651 (response to salt stress); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0043621 (GO:0043621); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051259 (protein complex oligomerization)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789150.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789150.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789150.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789150.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72574064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B7
`Chr1:72574109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B117
`Chr1:72574109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr1:72574134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B13,B37,B39
`Chr1:72574215`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B113,B53,B66,D2
`Chr1:72574215`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B113,B53,B66,D2
`Chr1:72574335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B13,B37,B39,C78
`Chr1:72574340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr1:72574403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B115,B66,C23,C25
`Chr1:72574408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:72574475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B78,C19
`Chr1:72574489`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A13,A8,B106,B109,B120,B123,B126,B134,B14,B140,B15,B17,B35,B36,B41,B44,B56,B65,B69,B70,B74,B79,B80,B84,B95,B96,C13,C14,C17,C24,C28,C30,C33,C44,C45,C56,C57,C70,C74,C77,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789150.1

154 aa

154

HSP20

PF00011 HSP20 50-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789150.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	50	153	1.3e-31	109.5	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933167.1
CTCGCAGAAGTTACCAGAAGGATCGAGAATGATTCGCTCATTTCACTAGTCCCCTATAAATGAGATGTTTTCTCCTACAAAGTTTCACATCGAGTAATTTCACACATCACCTAATCTGCTTCCAAACTATTCAGACAAATTAATTCTTTATTGATCAAATCTAAATCCAAAGCTGCAAGATGTCTCTGATTCCAATTCCAAGCTTCTTCGGCAGCCGCCGCAGCAACGTGTTCGACCCATTCTCCCTCGATATATGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006015
ATGTCTCTGATTCCAATTCCAAGCTTCTTCGGCAGCCGCCGCAGCAACGTGTTCGACCCATTCTCCCTCGATATATGGGATCGCTTCGAGGGTTTTAATTTCCCCTCCTCCGCCTGCGAAACCACCGCGGTGGCCAACGCCCGCATCGACTGGAAGGAGACGCCGGAGGCCCATCTCTTCAAGGTTGATGTTCCCGGATTGAAGAAAGAGGAAGTTAAGGTTGAGGTCGAAGATGGCGGCATTCTGAAAATAAGCGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789150.1
MSLIPIPSFFGSRRSNVFDPFSLDIWDRFEGFNFPSSACETTAVANARIDWKETPEAHLFKVDVPGLKKEEVKVEVEDGGILKISGERSKEQEEKNDKWHRVERSSGKFLRRFRLPENAKLEQVKAAMENGMLTVTVPKEEVKKPEVKAIDIST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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