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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005980`

染色体: Chr01 坐标: 75453629-75458168 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005980`
名称	SmilChr01G005980
描述	glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75453629 - 75458168 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006259`
GeneID	`131006259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006259`
原始查询	`LOC131006259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1-like
产物	glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G04500` (AT5G04500) glycosyltransferase family protein 47 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830329] identity=62; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0684500` - identity=60.9; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF09258 (Glyco_transf_64); PF24793 (GINT1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057789424.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057789424.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789424.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789424.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75453861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C63,C67
`Chr1:75453879`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr1:75453879`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr1:75453903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:75453905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:75453979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,C19,C49,C59
`Chr1:75453991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B53,C11,C5,C69
`Chr1:75454017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C14,C2
`Chr1:75454022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C72,D10
`Chr1:75454047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B82
`Chr1:75454072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:75454147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B29,C30,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789424.1

748 aa

374

748

GINT1_N

Glyco_transf_64

PF24793 GINT1_N 63-366 aa PF09258 Glyco_transf_64 500-739 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789424.1`	Pfam	`PF24793`	GINT1_N	Repeat	63	366	8.8e-179	593.8	Glucosamine inositolphosphorylceramide transferase 1, N-terminal
`XP_057789424.1`	Pfam	`PF09258`	Glyco_transf_64	Domain	500	739	3.6e-62	210.6	Glycosyl transferase family 64 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933441.1
GTGTTGAACAAAACGAATTCAATAATAAACCGACTGCGAATTTCTCTTTTACCGAAAAAAAAAAACACATTTTTTCTGTCAAAAACATACTCATTTTGTTCATTTCAGAAATGCAAAGACTTTTTTATGCAAACACACACAAACGTGTGTCTATATATGTGTGATTTTATACAGATGAGATGAGCACAGATTTAGAAAATTTCGAGCTCCTGCACAAGGTGGCCAACCCCCCCCCCACCCCACCCCACCCCCCAACTACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006259
ATGGGCTCGAGCCAAATCGCCGCCTCCGGCGGCGGCGGGAGCAAGAATGGGAGTAACGAGAAGTGCGCTCTGTCGCCAGCTTTTGCGTTTTTCTTGTTTTCCTTTGTCGTTTTGGGGTCGATTGGGAGCCTCTACGCGAGGCTTATGCTTGCTGCTAACGTGCGCGCGGGGATCACTGCACGCGGCTGCGAAGAAGACAATGAGGGCTCGTGGGCTATTGGCATTTACTACGGCGACTCCCCCTTTTCTCTTAAACCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789424.1
MGSSQIAASGGGGSKNGSNEKCALSPAFAFFLFSFVVLGSIGSLYARLMLAANVRAGITARGCEEDNEGSWAIGIYYGDSPFSLKPIEAMNIWKEKTAAWPVANPVVTCASLSDSGFPSNFVADPFLFLQGNTLYLFYETKNSITMQGDIGVARSVDKGATWEQLGIALDEDWHLSYPYVFEYNGNIYMMPEGSAKGDLRLYRATNFPLKWTLDRVVMKKPLVDSFMIPHEGKYWLFGSDHSGIGTRKNGQLEIWYSISP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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