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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006077`

染色体: Chr01 坐标: 76213285-76214871 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006077`
名称	SmilChr01G006077
描述	DNA excision repair protein ERCC-1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76213285 - 76214871 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006336`
GeneID	`131006336`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006336`
原始查询	`LOC131006336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA excision repair protein ERCC-1-like
产物	DNA excision repair protein ERCC-1-like
Arabidopsis	`AT3G05210` (ERCC1) nucleotide repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819685] identity=54.5; qcov=0.812; evalue=1.44e-36; confidence=medium
Rice	`Os10g0518900` (ERCC1) - identity=67.9; qcov=0.318; evalue=1.11e-20; confidence=low
GO	GO:0000110 (nucleotide-excision repair factor 1 complex); GO:0000710 (meiotic mismatch repair); GO:0003684 (damaged DNA binding); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006289 (nucleotide-excision repair); GO:0006312 (mitotic recombination); GO:0070522 (ERCC4-ERCC1 complex); GO:0070914 (UV-damage excision repair)
KEGG	-
Pfam	PF03834 (Rad10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006336

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057789530.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057789530.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057789530.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789530.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76213651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C39
`Chr1:76213658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B35,B57
`Chr1:76213663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B35,B57
`Chr1:76213675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B14
`Chr1:76213675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr1:76213691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr1:76213736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B43
`Chr1:76213745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B69,B72,C39,C64
`Chr1:76213749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C84
`Chr1:76213813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:76214011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B20,C50,C61
`Chr1:76214663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B15,B28,B79,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789530.1

176 aa

176

Rad10

PF03834 Rad10 103-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789530.1`	Pfam	`PF03834`	Rad10	Domain	103	147	2.1e-14	54.0	Binding domain of DNA repair protein Ercc1 (rad10/Swi10)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933547.1
GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCAGTGCAAATCATCCGTTCCGGCTAAATTGTTCCGCCATCACTTCTGCTCTTCCATTCGAGGAAGTAGAAAGGTGAATTAGGAGAGTGAGTTGTGAAGATGGAAAACAGAGGTGATCCTGAGCAGCAGAAACAGAATAATGCATCATTTGTTGTGAAAATACCTTCATATGAAGAGGTGGTTGAGAGCTCCCAACCTAAGTCGCAATCTTTATTCAAGCCTTCCTCCTCCTTTTCGCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006336
ATGGAAAACAGAGGTGATCCTGAGCAGCAGAAACAGAATAATGCATCATTTGTTGTGAAAATACCTTCATATGAAGAGGTGGTTGAGAGCTCCCAACCTAAGTCGCAATCTTTATTCAAGCCTTCCTCCTCCTTTTCGCAAGCTTTCAATTTTATCAAAAACACTGAATTTTACACCACCCCGCCGTCTGCACCAGTGGCTCAGTCCTCCAAAGATGCCCCTTCATCCTCTCAAGGATCCCATCCAAGGCAAACCATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789530.1
MENRGDPEQQKQNNASFVVKIPSYEEVVESSQPKSQSLFKPSSSFSQAFNFIKNTEFYTTPPSAPVAQSSKDAPSSSQGSHPRQTIHSEAPSTSVSSAAANRNAIIVSHRQKGNPLLKHIRNVRWVFADVVCDYLLGQNTCALYLRFEVKYSFIDVYMLESSTFPMAWFDSTLIPM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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