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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000613`

染色体: Chr01 坐标: 13552606-13552949 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000613`
名称	SmilChr01G000613
描述	uncharacterized SmilChr01G000613
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	13552606 - 13552949 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006645`
GeneID	`131006645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006645`
原始查询	`LOC131006645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0567000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0567000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G29735` (AT4G29735) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829095] identity=71.4; qcov=0.963; evalue=1.81e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0567000` - identity=69.2; qcov=0.975; evalue=2.74e-31; confidence=medium
GO	GO:0006487 (protein N-linked glycosylation); GO:0034998 (GO:0034998); GO:0043227 (membrane-bounded organelle)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05251 (Ost5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057789799.1`
2	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057789799.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057789799.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789799.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057789799.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:13552616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:13552655`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A21,A4,B108,B111,B120,B122,B127,B13,B130,B131,B140,B16,B22,B4,B44,B51,B56,B59,B85,B86,B96,C23,C36,C46,C62,C67,C76
`Chr1:13552663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:13552688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:13552699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:13552731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:13552766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C18,C25
`Chr1:13552771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:13552806`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A1,A13,A16,A18,A20,A22,A24,A7,B1,B11,B111,B112,B114,B120,B123,B129,B139,B20,B25,B26,B33,B34,B37,B40,B53,B6,B60,B62,B79,B8,B85,B88,B89,B90,B93,C10,C15,C16,C25,C27,C28,C32,C34,C37,C41,C42,C58,C67,C68,C74,C75,C78,C79,C81,C84,D2,D5,D6
`Chr1:13552816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789799.1

80 aa

Ost5

PF05251 Ost5 6-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789799.1`	Pfam	`PF05251`	Ost5	Family	6	80	8e-23	81.2	Oligosaccharyltransferase subunit 5

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933816.1
ATGACGCAATCAGCGAAACCAATCTCAAGCCCAGTTCCAGATGCATGGTACCCCCTCCCTACTCTCGCCGTTCTTCTGCTCGCCTTCGGCCTCGTCATTCTCGCCTCTTTCTTCATTTATGAAGCAACTTCCTCTAGGAAAAATTGCAATCTTGCAAAGGAATTGACTACTGGTGCAATTGCACCAGTTTTCTTGGGTTTCGGATCTCTGTTCTTGCTGCTCTCTTCTGGTGTCTATGTTTGAGTCTGTAACATCAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006645
ATGACGCAATCAGCGAAACCAATCTCAAGCCCAGTTCCAGATGCATGGTACCCCCTCCCTACTCTCGCCGTTCTTCTGCTCGCCTTCGGCCTCGTCATTCTCGCCTCTTTCTTCATTTATGAAGCAACTTCCTCTAGGAAAAATTGCAATCTTGCAAAGGAATTGACTACTGGTGCAATTGCACCAGTTTTCTTGGGTTTCGGATCTCTGTTCTTGCTGCTCTCTTCTGGTGTCTATGTTTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789799.1
MTQSAKPISSPVPDAWYPLPTLAVLLLAFGLVILASFFIYEATSSRKNCNLAKELTTGAIAPVFLGFGSLFLLLSSGVYV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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