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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000253`

染色体: Chr01 坐标: 4757624-4770045 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000253`
名称	SmilChr01G000253
描述	probable pectin methylesterase CGR2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	4757624 - 4770045 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006683`
GeneID	`131006683`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006683`
原始查询	`LOC131006683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectin methylesterase CGR2
产物	probable pectin methylesterase CGR2
Arabidopsis	`AT3G49720` (AT3G49720) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824134] identity=67.2; qcov=0.664; evalue=1.86e-86; confidence=high
Rice	`Os01g0144000` - identity=58.1; qcov=0.657; evalue=5.58e-73; confidence=high
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0045488 (pectin metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF08241 (Methyltransf_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006683

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057789842.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789842.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057789842.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789842.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:4757630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:4757661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:4757677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C25,C36,C43
`Chr1:4757683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,C12,C31,C51
`Chr1:4757724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:4757729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B24,B9,C13,C61
`Chr1:4757737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C13,C61
`Chr1:4757743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C13,C61
`Chr1:4757754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C44
`Chr1:4757755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C51
`Chr1:4757785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C35
`Chr1:4757823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C18,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789842.1

280 aa

140

280

Methyltransf_11

PF08241 Methyltransf_11 152-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789842.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	152	243	0.00017	22.9	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933859.1
ATGACGGTCGGCCATGGACGGACCCAGCCATTACAGCGTCATATTACTGCCGACGGAATCGAGATATGGGTACCTGTTCCCGAGGTGCCGGTTTATGGCCCGATGGTGGACACCGACGTCGAGAATGAGTCGAGCGACGATAGAGTCTACCGACTGATCGACGAGTACGAGAGTCAGGAGTCAGAGCCGAGCGAGGAGACAGAGCCGAGGGAGGATATGGAGTATGTCAGTCTATATTCCTACTGGAAAGGTTTCTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006683
ATGACGGTCGGCCATGGACGGACCCAGCCATTACAGCGTCATATTACTGCCGACGGAATCGAGATATGGGTACCTGTTCCCGAGGTGCCGGTTTATGGCCCGATGGTGGACACCGACGTCGAGAATGAGTCGAGCGACGATAGAGTCTACCGACTGATCGACGAGTACGAGAGTCAGGAGTCAGAGCCGAGCGAGGAGACAGAGCCGAGGGAGGATATGGAGTATGTCAGTCTATATTCCTACTGGAAAGGTTTCTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789842.1
MTVGHGRTQPLQRHITADGIEIWVPVPEVPVYGPMVDTDVENESSDDRVYRLIDEYESQESEPSEETEPREDMEYVSLYSYWKGFFSSLLSIGIFVVGALLVVGYLYHSSGSRSGDINSLSRLEGGVSCTLEVQKIIPILKKTYGDSMKKVLHVGPGTCSVVSQLLKQEDTEVWGIEPYELDDADASCKNLVRKGIVRVADIKFPLPYRPKTFSLVIVSDALDYLSPKYLNKTVPQLARVASDGLVILSGYPGQQRAKVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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