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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000847`

染色体: Chr01 坐标: 18314551-18321642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000847`
名称	SmilChr01G000847
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD11
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18314551 - 18321642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006833`
GeneID	`131006833`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006833`
原始查询	`LOC131006833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD11
产物	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD11
Arabidopsis	`AT3G07940` (AT3G07940) Calcium-dependent ARF-type GTPase activating protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819985] identity=55; qcov=1.07; evalue=3.5e-137; confidence=high
Rice	`Os01g0951100` - identity=55.3; qcov=0.959; evalue=1.27e-129; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005543 (phospholipid binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2); PF01412 (ArfGap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006833

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789978.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789978.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057789979.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789978.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18315733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:18319695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:18321298`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B89
`Chr1:18321298`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B89
`Chr1:18321364`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C4
`Chr1:18321364`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789978.1

383 aa

192

383

ArfGap

PF01412 ArfGap 91-183 aa PF00168 C2 245-337 aa

XP_057789979.1

362 aa

181

362

ArfGap

PF01412 ArfGap 48-162 aa PF00168 C2 224-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789978.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	91	183	6.8e-34	117.2	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057789978.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	245	337	2.4e-23	83.0	C2 domain
`XP_057789979.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	48	162	1.2e-38	132.5	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057789979.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	224	316	2.2e-23	83.2	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933995.1
GTCCATGTACAGATGTACTAGCCTAGTCAACTGAGAAAATTAGCATTTGTTTCCCGTCAATCATAACTGCCAGATATAATCCACACCGCCGCTTAAAAATCTCTTCTGATTGTTAATTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAATTCTGATTGTTATTCTTATTACCTTTCTTTCTCAAAGAAAAAAAGGATCGGAAGAATGCCATCACCTTTGATCTTGTTGCTTGCCTGCTAAATACATTTTTTCTCAAATTTTCTACAAAA...

XM_057933996.1
GTCCATGTACAGATGTACTAGCCTAGTCAACTGAGAAAATTAGCATTTGTTTCCCGTCAATCATAACTGCCAGATATAATCCACACCGCCGCTTAAAAATCTCTTCTGATTGTTAATTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAATTCTGATTGTTATTCTTATTACCTTTCTTTCTCAAAGAAAAAAAGGATCGGAAGAATGCCATCACCTTTGATCTTGTTGCTTGCCTGCTAAATACATTTTTTCTCAAATTTTCTACAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006833
ATGTCTATTCATGAAGACAACAAGAAGGAAACTAAAGAAGTTCCAGGTGCCTGTCTTTATGACCTCCTTAAAATGGAGACCTCTTCAAAGTGGGGTCACTACTCAAAAAAATGGAAGAATTCTGCTCTAGGTGCACGAGCGAGGCTGGAGAGTCTATTATCTGAAGCTGGCAATAGAACTTGTGCAGATTGTGGATCACCGGATCCAAAATGGGTGTACTTCTCAGAATTAATACTCATCTTAGTTCATCTATTTATCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789978.1
MSIHEDNKKETKEVPGACLYDLLKMETSSKWGHYSKKWKNSALGARARLESLLSEAGNRTCADCGSPDPKWVYFSELILILVHLFIYGSCWISSLTTGAFICIKCSGVHRSLGVHISQVFSVKLDEWTHEQVDTITEMGGNSVVNLKFEAQIPDNYKKPNPDSTAQERTDFIRRKYELQQFLNSGLPPPCPFPSSSTSYQNSALPTDKKHQHEKRTSGNRNNRKRSEKTSKITNSTAGMVEFVGLIKVNIIRGTNLVVRD...

XP_057789979.1
MSIHEDNKKETKEVPGACLYDLLKMETSSKWGHYSKKWKNSALGARARLESLLSEAGNRTCADCGSPDPKWVSLTTGAFICIKCSGVHRSLGVHISQVFSVKLDEWTHEQVDTITEMGGNSVVNLKFEAQIPDNYKKPNPDSTAQERTDFIRRKYELQQFLNSGLPPPCPFPSSSTSYQNSALPTDKKHQHEKRTSGNRNNRKRSEKTSKITNSTAGMVEFVGLIKVNIIRGTNLVVRDMVSSDPYVVLSLGNQSMKTRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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