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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001076`

染色体: Chr01 坐标: 22168311-22170008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001076`
名称	SmilChr01G001076
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22168311 - 22170008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007017`
GeneID	`131007017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007017`
原始查询	`LOC131007017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
产物	protein DUF642 L-GALACTONO-1%2C4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
Arabidopsis	`AT3G08030` (AT3G08030) DNA-directed RNA polymerase subunit beta (Protein of unknown function, DUF642) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819994] identity=69.3; qcov=0.919; evalue=2.03e-176; confidence=high
Rice	`Os03g0807700` - identity=62.2; qcov=0.924; evalue=4.01e-155; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04862 (DUF642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057790144.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057790144.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790144.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790144.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22168472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:22168705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C85
`Chr1:22169167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:22169213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:22169252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:22169305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr1:22169346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C60,C85
`Chr1:22169347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:22169420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B50,C56,C87
`Chr1:22169469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:22169522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:22169535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790144.1

369 aa

184

369

DUF642

PF04862 DUF642 29-185 aa PF04862 DUF642 197-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790144.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	29	185	3.1e-80	268.2	Protein of unknown function (DUF642)
`XP_057790144.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	197	363	3.1e-80	268.2	Protein of unknown function (DUF642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934161.1
TTATCCACCTGCACTTCTTCTTCTTGTCCCTCTCTCACACACACGCACATTATGCTATATAAATATAGCTAGCAATGATGCTCTAATGCTCATCATTACCTTCATCTAAGAACCTCCTCCCTCTTAAACAACAAAACACACATCACACTTACACACACACACACAAATGGCTATGAAGATGTGTTTTCTGCTCTCTGTGTACTTTGTCTGTGCTGTTTCAGCCATTGCACCACCTACTCCTCCTTTGGAAGGGCTCCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007017
ATGGCTATGAAGATGTGTTTTCTGCTCTCTGTGTACTTTGTCTGTGCTGTTTCAGCCATTGCACCACCTACTCCTCCTTTGGAAGGGCTCCTACCCAATGGGAATTTCGAAGAACAACCACATGCCCAAAACATAAACGAAACAGTGCTCCGAGGCAAGAACGCACTGCCCAAATGGGAAATCAACGGAACGGTGGAGTACATCTCCGGCGGCCCTCAGCCCGGAGGGATGTACTACGCTGTGGCGCACGGCATCCATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790144.1
MAMKMCFLLSVYFVCAVSAIAPPTPPLEGLLPNGNFEEQPHAQNINETVLRGKNALPKWEINGTVEYISGGPQPGGMYYAVAHGIHAIRLGSGASISQTVRVRNGSLYALTFGASRTCAQDEVLRVSVPGQTGDLPLQTLYSSNGGDTYAWGFRAYSNSVNLSFYNPGMQEDPACGPLLDAVAIKELFPPRPTLVNLVKNTGFEEGPHILINSSHGVLLPPKQEDWTSPLPGWIIVSLKAVKFIDSEHFNVPYGRAAVEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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