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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002022`

染色体: Chr01 坐标: 35780530-35792602 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002022`
名称	SmilChr01G002022
描述	asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35780530 - 35792602 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007164`
GeneID	`131007164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007164`
原始查询	`LOC131007164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic 2-like
产物	asparagine--tRNA ligase%2C cytoplasmic 2-like
Arabidopsis	`AT3G07420` (NS2) asparaginyl-tRNA synthetase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819930] identity=47.9; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0372700` - identity=40.3; qcov=0.913; evalue=3.52e-145; confidence=medium
GO	GO:0004816 (asparagine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006421 (asparaginyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00152 (tRNA-synt_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790313.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057790313.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790313.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790313.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35780642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr1:35780642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:35781502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B122,B136,B66
`Chr1:35790190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C46
`Chr1:35790211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:35790384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:35791003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B99
`Chr1:35791382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:35791564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:35791904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C66
`Chr1:35792046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,C18,C71,C86
`Chr1:35792107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790313.1

631 aa

316

631

tRNA-synt_2

PF00152 tRNA-synt_2 353-624 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790313.1`	Pfam	`PF00152`	tRNA-synt_2	Domain	353	624	2.2e-33	116.3	tRNA synthetases class II (D, K and N)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934330.1
ATGACGGCAGTTACGTTGTGGAAGCTTCTGCTATTGGGAGACCAATGGGTCCTCCCGTCGGATCAAGCCCCATGTGCAGGTGTAGGCCCAACCGGATTGGGCCTCGTTATTTGGGCCAAGAAATCATTAGTCCAAAAAGATAAGTTATATGAATTCGTAATCAAAAAATCCCCACTACCCCTCTCCAAATACTCCAAAAGGGTCACCTTGGACTCAATCTCCAGCCGCCCAGACGGCGGCGTGGGGCTGATCGGACAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007164
ATGACGGCAGTTACGTTGTGGAAGCTTCTGCTATTGGGAGACCAATGGGTCCTCCCGTCGGATCAAGCCCCATGTGCAGGTGTAGGCCCAACCGGATTGGGCCTCGTTATTTGGGCCAAGAAATCATTAGTCCAAAAAGATAAGTTATATGAATTCGTAATCAAAAAATCCCCACTACCCCTCTCCAAATACTCCAAAAGGGTCACCTTGGACTCAATCTCCAGCCGCCCAGACGGCGGCGTGGGGCTGATCGGACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790313.1
MTAVTLWKLLLLGDQWVLPSDQAPCAGVGPTGLGLVIWAKKSLVQKDKLYEFVIKKSPLPLSKYSKRVTLDSISSRPDGGVGLIGQRVVVGGWVKSSREFKAAAPPPAAGAPKDISCVEVLQTKLPFFRSIIKAFGGEQRIRDKIESVLPKPPQPSISILQISDGSCVSSLQVVVDSGLAQPAHIMATGTCILVEGLFQKPSLLEKEKYRIEVKAENILHIGSVDQDRYPLSKKRLPLELLRDSAHFRPRTTTVASVMRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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