当前解析结果
SmilChr01G000049| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000049 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000049 |
| 描述 | pectinesterase 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 769749 - 772394 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007171 |
|---|---|
| GeneID | 131007171 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007171 |
| 原始查询 | LOC131007171 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pectinesterase 4-like |
| 产物 | pectinesterase 4-like |
| Arabidopsis | AT2G47030 (VGDH1)Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819317] identity=49; qcov=0.927; evalue=1.51e-100; confidence=high |
| Rice | Os04g0458900 (OsPME14)- identity=49.3; qcov=0.921; evalue=3.85e-97; confidence=high |
| GO | GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity) |
| KEGG | smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01095 (Pectinesterase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007171 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057790322.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057790322.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057790322.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790322.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790322.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790322.1PF01095
Pectinesterase 25-311 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790322.1 |
Pfam | PF01095 |
Pectinesterase | Repeat | 25 | 311 | 3.9e-104 | 348.3 | Pectinesterase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。