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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000038`

染色体: Chr01 坐标: 611818-613189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000038`
名称	SmilChr01G000038
描述	uncharacterized SmilChr01G000038
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	611818 - 613189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007174`
GeneID	`131007174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007174`
原始查询	`LOC131007174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0467600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0467600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0467600` - identity=34.6; qcov=0.481; evalue=8.53e-07; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04504 (GeBP-like_DBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790326.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790326.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790326.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790326.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:612415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C26
`Chr1:612451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:612531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:612560`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C61
`Chr1:612560`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C61
`Chr1:612656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:612676`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B1,B22,B24,B53,B55,B63,B68,C26,C6,C76,C85
`Chr1:612723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:612734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B53,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790326.1

235 aa

118

235

GeBP-like_DBD

PF04504 GeBP-like_DBD 41-127 aa

XP_057790327.1

235 aa

118

235

GeBP-like_DBD

PF04504 GeBP-like_DBD 41-127 aa

XP_057790328.1

223 aa

112

223

GeBP-like_DBD

PF04504 GeBP-like_DBD 41-127 aa

XP_057790329.1

216 aa

108

216

GeBP-like_DBD

PF04504 GeBP-like_DBD 41-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790326.1`	Pfam	`PF04504`	GeBP-like_DBD	Domain	41	127	1.2e-14	55.5	Glabrous-enhancer-binding protein-like family, DBD domain
`XP_057790327.1`	Pfam	`PF04504`	GeBP-like_DBD	Domain	41	127	1.2e-14	55.5	Glabrous-enhancer-binding protein-like family, DBD domain
`XP_057790328.1`	Pfam	`PF04504`	GeBP-like_DBD	Domain	41	127	4.4e-15	56.9	Glabrous-enhancer-binding protein-like family, DBD domain
`XP_057790329.1`	Pfam	`PF04504`	GeBP-like_DBD	Domain	41	127	5e-15	56.7	Glabrous-enhancer-binding protein-like family, DBD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934344.1
AAAAACCGGGTTTTAAGTGAGTGTCCAATTATCACTACCCTTGTATTAATTGCCTTTATTAAATAATCATCATCACACAATTAATAGAGCCGAAAACGAAGTGGAGTAGTATTTTAGAACCCTAAAACAAGCAGGCGCAGCGGTTGAGTTCCCCAAAAAGGCGGGTGTTAGAGTTGTCCGATGTTGGCGAAAGAAAACGAGATGCGCAAGCAAGGTGATTCTGATTGCAGTTCCGATTCTGGGAGCGGAGCACAAGCTAT...

XM_057934346.1
AACCAAAAATCGGCTCATTCTCTACCAAGCCAAAAAACCGGGTTTTAAGTGAGTGTCCAATTATCACTACCCTTGTATTAATTGCCTTTATTAAATAATCATCATCACACAATTAATAGAGCCGAAAACGAAGTGGAGTAGTATTTTAGAACCCTAAAACAAGCAGGCGCAGCGGTTGAGTTCCCCAAAAAGGCGGGTGTTAGAGTTGTCCGATGTTGGCGAAAGAAAACGAGATGCGCAAGCAAGGTGATTCTGATTGC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131007174
ATGTTGGCGAAAGAAAACGAGATGCGCAAGCAAGGTGATTCTGATTGCAGTTCCGATTCTGGGAGCGGAGCACAAGCTATGACGCTAGCACTGAAACCGAAACACCCGCCGTCGTCGTCGTCTAAGGTATTTAGCGACGAAGACTCAATAACGCTGTTAAAGAGTCTCGCCGTTTTCTGGGCTAGTGGTAGAAATAATAAGTGGGCAGACTTCCACCGGATTGTCAAGGACAAACTTTCCAAGCCAGATTTTACGCGCGT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057790326.1
MLAKENEMRKQGDSDCSSDSGSGAQAMTLALKPKHPPSSSSKVFSDEDSITLLKSLAVFWASGRNNKWADFHRIVKDKLSKPDFTRVQISEKVRSLNKKYKTNWQRGRVPDNPHELVVYELSKPLWEDEMNQESGKVWEDEMNQESGKGMKKNKKRKRERNPTLDEFRSSYPNLYASFNMFGFPKIARKRCVLLGREKAQKLENEWKQLTEELHCLEGKRLALSTKPTGDNSEEG

XP_057790327.1
MLAKENEMRKQGDSDCSSDSGSGAQAMTLALKPKHPPSSSSKVFSDEDSITLLKSLAVFWASGRNNKWADFHRIVKDKLSKPDFTRVQISEKVRSLNKKYKTNWQRGRVPDNPHELVVYELSKPLWEDEMNQESGKVWEDEMNQESGKGMKKNKKRKRERNPTLDEFRSSYPNLYASFNMFGFPKIARKRCVLLGREKAQKLENEWKQLTEELHCLEGKRLALSTKPTGDNSEEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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