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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000028`

染色体: Chr01 坐标: 541403-542364 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000028`
名称	SmilChr01G000028
描述	uncharacterized SmilChr01G000028
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	541403 - 542364 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007179`
GeneID	`131007179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007179`
原始查询	`LOC131007179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825392]; symbol=AT3G62190; hit=AT3G62190; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825392]; symbol=AT3G62190; hit=AT3G62190; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G62190` (AT3G62190) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825392] identity=47.8; qcov=1.1; evalue=3.88e-35; confidence=medium
Rice	`Os07g0637100` - identity=49.2; qcov=0.536; evalue=1.53e-15; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0044183 (protein folding chaperone); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding); GO:0061077 (GO:0061077)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790334.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057790334.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790334.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790334.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:541788`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A1,A14,A16,A18,A21,A22,A24,A5,A8,B1,B105,B109,B117,B120,B122,B124,B126,B127,B129,B13,B130,B15,B16,B22,B23,B24,B25,B27,B3,B33,B35,B44,B46,B5,B50,B53,B55,B58,B63,B66,B68,B7,B74,B79,B8,B83,B86,B87,B88,B93,C14,C16,C18,C19,C21,C26,C28,C29,C3,C31,C35,C42,C44,C45,C47,C5,C54,C59,C60,C62,C65,C73,C79,C80,C82,C85,C9,D10,D6,D9
`Chr1:541790`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	79	A11,A2,A3,A4,A6,B10,B100,B102,B103,B104,B108,B11,B110,B113,B123,B134,B136,B138,B139,B140,B19,B20,B26,B30,B31,B36,B38,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B49,B54,B57,B62,B71,B72,B73,B75,B76,B9,B94,C1,C10,C12,C15,C17,C23,C25,C27,C32,C34,C37,C38,C40,C41,C43,C48,C50,C51,C55,C56,C6,C61,C63,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C77,C84,C86,D11,D7,D8
`Chr1:541792`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	80	A1,A14,A16,A18,A21,A22,A24,A5,A8,B1,B105,B109,B117,B120,B122,B124,B126,B127,B129,B13,B130,B15,B16,B22,B23,B24,B25,B27,B3,B33,B35,B44,B46,B5,B50,B53,B55,B58,B63,B66,B68,B7,B74,B79,B8,B83,B86,B87,B88,B93,C14,C16,C18,C19,C21,C26,C28,C29,C3,C31,C35,C42,C44,C45,C47,C5,C54,C59,C60,C62,C65,C73,C79,C80,C82,C85,C9,D10,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790334.1

125 aa

125

DnaJ

PF00226 DnaJ 10-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790334.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	10	67	2.3e-10	41.2	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934351.1
ATGGTTTGGGACGTATTTGAAAAATAAAGTGATTGTAATTTGTAAGCGCCTGAAAAAGTAGTTTTGTAAAATGTGGACGTGGAGGTTGGATCCAACTCAAAAGCGGGCGGCGGTGAATTCTGAATTTTGAGTTGAAGCATTCATTATGCGAAACGACGAGGCCAATATCTTGCTGGGCTTCCCACCCAATTCCGTTCCCTCCCAATCTCAGATCAAGTCTGCCTACAGAAGGAAGGTTTGGGAAACTCATCCCGATCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007179
ATGCGAAACGACGAGGCCAATATCTTGCTGGGCTTCCCACCCAATTCCGTTCCCTCCCAATCTCAGATCAAGTCTGCCTACAGAAGGAAGGTTTGGGAAACTCATCCCGATCGATTTCCACCTCATCTGAAACCCGAAGCCGAGTCCAATTTCAAATTGGTCTCGGAAGCGCATACTTTGTTGAACTCTCAAGTTGGAAGAAGAGGGTCGAGGAGTGGAGTCGGAAGCTCCAAGGTGGGACGAGGCAGCATGGGAGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790334.1
MRNDEANILLGFPPNSVPSQSQIKSAYRRKVWETHPDRFPPHLKPEAESNFKLVSEAHTLLNSQVGRRGSRSGVGSSKVGRGSMGAASIPFVFIIFGALALGGSTASRAYQRQKEAHPCFNPFLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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