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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000058`

染色体: Chr01 坐标: 905074-909862 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000058`
名称	SmilChr01G000058
描述	ABC transporter B family member 21-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	905074 - 909862 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007204`
GeneID	`131007204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007204`
原始查询	`LOC131007204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter B family member 21-like
产物	ABC transporter B family member 21-like
Arabidopsis	`AT3G62150` (ABCB21) P-glycoprotein 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825388] identity=70.5; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0695700` (OsABCB4) - identity=55.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790340.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057790340.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057790340.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790340.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:905414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:905471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C2,C8,D10
`Chr1:905543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B57
`Chr1:905549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B57
`Chr1:905554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr1:905565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B57
`Chr1:905565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr1:905743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:905906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:905974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:905975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:905989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B16,C3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790340.1

1261 aa

630

1261

ABC_membrane

ABC_tran

ABC_membrane

ABC_tran

PF00664 ABC_membrane 44-312 aa PF00005 ABC_tran 380-528 aa PF00664 ABC_membrane 699-969 aa PF00005 ABC_tran 1037-1186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790340.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	44	312	2.4e-111	372.5	ABC transporter transmembrane region
`XP_057790340.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	380	528	6.2e-71	238.1	ABC transporter
`XP_057790340.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	699	969	2.4e-111	372.5	ABC transporter transmembrane region
`XP_057790340.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	1037	1186	6.2e-71	238.1	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934357.1
CATTCGGCCAACCCAACTAACTTATGCTGTATATATAAATATATATAGATGTTTACATTCACTTCCTCCGGCTCTTGAATTGATCTCCTCAACTCTCATTCTCTCAACTCAATATATATTTATTTGTGTCTTGTCATTATTGAGTGATCAGCAAATCAGAAAAGAAGATTGGTGTAATAAGTTAAAAGTGAAAGATGGGTGGAGAGGAAGAGGCATTGGCCGACGGTGGCAGCCCAAAGGCGGAGGAGCTGAATGTGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007204
ATGGGTGGAGAGGAAGAGGCATTGGCCGACGGTGGCAGCCCAAAGGCGGAGGAGCTGAATGTGGTTCCATTCTACAAACTGTTTGTGTTCTCGGACTGGTGGGACAAGATCCTGATGTTGGTGGGAAGCATGGGCGCCATTGGCAACGGCATGAACCCGCCTCTCATGGCCTTGCTCTTCGGGGAGCTGGCCGATGCCTTTGGCCGCACCCAGACCCATAACGTGCTCCCCGTCGTTTGTAAGGTCTCACTGAAGCTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790340.1
MGGEEEALADGGSPKAEELNVVPFYKLFVFSDWWDKILMLVGSMGAIGNGMNPPLMALLFGELADAFGRTQTHNVLPVVCKVSLKLVYVALGCGAAAFLQVACWMITGERQAARIRALYLQTILQQDIAFFDKEVHTGEVIGRMSGDTVLIQDAIGEKVGKFVQLMATFFGGFVIAFTKGWLLTLVMLSSIPPLMISGGLMSQVVAKMASRGQNAYAAAAIIVEQTIGAIRTVASYTGEKRAVSEYNKSLDNAYKSSVHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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