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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000081`

染色体: Chr01 坐标: 1513404-1516746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000081`
名称	SmilChr01G000081
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP43-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1513404 - 1516746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007221`
GeneID	`131007221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007221`
原始查询	`LOC131007221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP43-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP43-like
Arabidopsis	`AT5G05420` (AT5G05420) FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830425] identity=40.1; qcov=0.359; evalue=6.75e-24; confidence=low
Rice	`Os09g0103800` (OsFKBP59) - identity=35.6; qcov=0.353; evalue=4.92e-14; confidence=low
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790356.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790358.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1514575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:1514696`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A11,A5,B108,B136,B140,B15,B31,B40,B49,B54,B63,C1,C29,C40,C43,C47,C55,C83,D6
`Chr1:1514699`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A11,A5,B108,B136,B140,B31,B40,B49,B54,B63,C1,C29,C40,C43,C47,C55,C83,D6
`Chr1:1515224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:1515374`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr1:1515374`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B70
`Chr1:1515877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790356.1

401 aa

200

401

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 307-395 aa

XP_057790357.1

401 aa

200

401

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 307-395 aa

XP_057790358.1

383 aa

192

383

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 289-377 aa

XP_057790359.1

382 aa

191

382

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 288-376 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790356.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	307	395	6.5e-23	81.6	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057790357.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	307	395	6.5e-23	81.6	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057790358.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	289	377	5.7e-23	81.8	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057790359.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	288	376	5.6e-23	81.8	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934373.1
AATAGGTTTAAAATAAAAGAACCGGATATATACGGATGGTTCGATACTGAAAACCTTATTCATAGTATTTAAAAGGGTAAATAAATAACGGTTAGGATTGGAGTGGGTGTGAAGCTGTCGTCTAGCTGTGAAGCAGAACTACTGCAACAGACAGCTTCTCCATCTTCTTCTGTTGGCCGCCAATTTTATTGCTAATCCCAGGTAAGCAAAGAGACACAGAAGAAAGATTAAGCGATGAAAGGTGCGTCTCTCATAAAAAT...

XM_057934376.1
AAACCTTATTCATAGTATTTAAAAGGGTAAATAAATAACGGTTAGGATTGGAGTGGGTGTGAAGCTGTCGTCTAGCTGTGAAGCAGAACTACTGCAACAGACAGCTTCTCCATCTTCTTCTGTTGGCCGCCAATTTTATTGCTAATCCCAGGTAAGCAAAGAGACACAGAAGAAAGATTAAGCGATGAAAGGTGCGTCTCTCATAAAAATGGAGTCCGGGTCGGATTTGGATGTGGAACTACTTCAAGTGTATCAGAAAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131007221
ATGAAAGGTGCGTCTCTCATAAAAATGGAGTCCGGGTCGGATTTGGATGTGGAACTACTTCAAGTGTATCAGAAAATGTTAACTCTTCAGCACACACAGTGTGGAATGCTTCTTCAAGAGTTCAACACTCGCTCCTCTTCCTCAAAGAAGAAGCGAGAGAAGAAGCGAAAGCGAAGTGAGAAAAAAAGGGACATGTCCCAACCACTACTCATTGAAGCAGATAAGGAAGCCACCACTCTAGAACAACAACAACGTGATGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057790356.1
MKGASLIKMESGSDLDVELLQVYQKMLTLQHTQCGMLLQEFNTRSSSSKKKREKKRKRSEKKRDMSQPLLIEADKEATTLEQQQRDESKEERELSLQIIEPPVDGGIFNKEEMNIVEGEEKIENKAKELENKDVDLSIVCVEEKIENKAEELENKAADLSIACVEEKIENKAEELENKTADLSISLEDKIENQQLVPPNSGVMDNDVPSSSVMDNVVSLPALLRDVKVEDDGTKKTSSKKKKKKEDRKEEKMKEDRKEKK...

XP_057790357.1
MKGASLIKMESGSDLDVELLQVYQKMLTLQHTQCGMLLQEFNTRSSSSKKKREKKRKRSEKKRDMSQPLLIEADKEATTLEQQQRDESKEERELSLQIIEPPVDGGIFNKEEMNIVEGEEKIENKAKELENKDVDLSIVCVEEKIENKAEELENKAADLSIACVEEKIENKAEELENKTADLSISLEDKIENQQLVPPNSGVMDNDVPSSSVMDNVVSLPALLRDVKVEDDGTKKTSSKKKKKKEDRKEEKMKEDRKEKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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