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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000093`

染色体: Chr01 坐标: 1661439-1664496 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000093`
名称	SmilChr01G000093
描述	pectinesterase 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1661439 - 1664496 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007229`
GeneID	`131007229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007229`
原始查询	`LOC131007229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase 4-like
产物	pectinesterase 4-like
Arabidopsis	`AT2G47030` (VGDH1) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819317] identity=49.8; qcov=0.929; evalue=3.72e-106; confidence=high
Rice	`Os04g0458900` (OsPME14) - identity=49.1; qcov=0.967; evalue=6.46e-105; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790366.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057790366.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057790366.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790366.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1661484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B2
`Chr1:1661539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:1661639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C18
`Chr1:1661672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:1661768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:1662120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B53,B55,C85
`Chr1:1662321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:1662398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B89,C2,C72
`Chr1:1662438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B74,C18
`Chr1:1662461`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B36,B49,C51,C6,C77
`Chr1:1662461`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B36,B49,C51,C6,C77
`Chr1:1662496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790366.1

337 aa

168

337

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 24-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790366.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	24	320	4.7e-109	364.4	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934383.1
CATTCTAATTTCTCAACATTTCTGTCTCGATCCTCTGTGAAAATCCAATCATCTCTCAATCACAATTATTCGAATTACTACTATCGTATCTCGATCCTCTTCGATTTCTAACATTTTTTCGATTGATTTGCTTAATTCAAAATTTCCTATGGATCGATCTTAATTTGATATTTTTCTGCATCAGTTTTTCAATTCTATGATTGAACAATTGATTGCATATTTGAATGTTCTACAGTGAAGATGAGAATAGATCTGTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007229
ATGAAAATATGTCCTTTTGTAACGATGTGGAAGCTTCTGGCCAAGCATTCCGGCGGGCAGCTGGTGCCCGATGTGGTGGTGGCCAAGGACGGCAGCGGCAAGTTCAAGACCATCAGCGAAGCTCTCAATGCTTACCCGCCCAAATTCAAGGGCAGATTCGTCATCCACGTCAAGGCCGGCGTCTACAACGAGCAGGTCATCGTGGACAAGAAGAAGCCTAATGTCTTCATCTACGGAGACGGCATTGCCAAGACCATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790366.1
MKICPFVTMWKLLAKHSGGQLVPDVVVAKDGSGKFKTISEALNAYPPKFKGRFVIHVKAGVYNEQVIVDKKKPNVFIYGDGIAKTIVTGSKNYGIMNIGTMHTATFANEASGFIARGMSFRNEAGPQGHQAVAFRSQGDKTALFDCSFEGSQDTLYYQNLKQFYRNCRIYGTVDFIFGKGDCIIQDSQIIVRKPLPNQFNTVTADGREIKRGSNGLVLHHCSIVPDDYLWPVRFQIPTFLGRPWKPEALTVVMQSTLGDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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