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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000108`

染色体: Chr01 坐标: 1852665-1854729 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000108`
名称	SmilChr01G000108
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1852665 - 1854729 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007239`
GeneID	`131007239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007239`
原始查询	`LOC131007239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
产物	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
Arabidopsis	`AT1G56670` (AT1G56670) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842122] identity=53.7; qcov=1.03; evalue=2.18e-131; confidence=high
Rice	`Os01g0329900` (OsGELP14) - identity=50.6; qcov=1.02; evalue=1.7e-117; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057790371.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057790371.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790371.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790371.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1853224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C27,C41
`Chr1:1853248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B72,C70
`Chr1:1853251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:1853270`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr1:1853270`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr1:1853273`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr1:1853273`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr1:1853288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:1854230`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A19,A23,B139,B21,B38,B59,B91,C19,C2,C57,C74
`Chr1:1854252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B49,C42,C51,C77
`Chr1:1854261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B50,B56,B96,B99
`Chr1:1854276`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B91,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790371.1

356 aa

178

356

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 34-338 aa

XP_057790372.1

335 aa

168

335

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 13-317 aa

XP_057790373.1

324 aa

162

324

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 2-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790371.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	34	338	9.5e-43	147.5	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
`XP_057790372.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	13	317	7.7e-43	147.8	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
`XP_057790373.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	2	306	6.8e-43	148.0	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934389.1
GTCGAATTAGTGCTTTATCTAGAATAAATCAATACTAGTTAGTCAATAATGTGAAAACACAAAGGAAATAGTCGTCTTTTTTTTAAGAAAATGAAAGAGTTTTGACTTGCTAGATTCTTCATTTAGGCCTATCTACATCCACTAATCTCAACACTTAATGAGCAAAAATGGTGCCGTATATCTGTCAACTGATCATAATAATAGCAATTAGATTAAGATTTTATATGCGTTGGGACAAAACGCATTTCTCCCACCATTTA...

XM_057934390.1
ATACTCCCATTTAACAAGATATATTCTGGTCTCTATATATATTAAGTGCAGCAGGAAAGCAGTGATGTTCAACTTTGGCGATTCAAATTCAGACACCGGCGGCCTTGCTGCTGCGATGGGCTACGAGTTCGGATATCCGGACGGCCGCGCCTTCTTCCATCGCCCCACAGGTCGACTATGTGATGGTCGCCTTATCATCGATTTCCTGTGCGAAAATGTGAAGTCAAATTACTTGAGTCCATATCTGGAATCAGTGGAGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131007239
ATGACAAGCATTTTGTGCAGCAGGAAAGCAGTGATGTTCAACTTTGGCGATTCAAATTCAGACACCGGCGGCCTTGCTGCTGCGATGGGCTACGAGTTCGGATATCCGGACGGCCGCGCCTTCTTCCATCGCCCCACAGGTCGACTATGTGATGGTCGCCTTATCATCGATTTCCTGTGCGAAAATGTGAAGTCAAATTACTTGAGTCCATATCTGGAATCAGTGGAGCCAGATTTCTCAAATGGAGCCAACTTCGCCAT...

LOC131007239
ATGTGTTGTTATTACAAAAAAGGGTTTGTCTTAGCTTGTGTGACGTTTTCAATGCTCATGTTTGATGCTGCTTCACAGTGCAGCAGGAAAGCAGTGATGTTCAACTTTGGCGATTCAAATTCAGACACCGGCGGCCTTGCTGCTGCGATGGGCTACGAGTTCGGATATCCGGACGGCCGCGCCTTCTTCCATCGCCCCACAGGTCGACTATGTGATGGTCGCCTTATCATCGATTTCCTGTGCGAAAATGTGAAGTCAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057790371.1
MCCYYKKGFVLACVTFSMLMFDAASQCSRKAVMFNFGDSNSDTGGLAAAMGYEFGYPDGRAFFHRPTGRLCDGRLIIDFLCENVKSNYLSPYLESVEPDFSNGANFAIAGSATLPRYVAFSLSVQILEFRRFRNHSLQLQSKGHVVGEDDFKNGLYMIDIGQNDLTAAFNNVPYDQVLEKIPSFISEIKDAMWSIYLTGGKKLWVHNTGPLGCLPEKLGTLKPTASQVDEHGCVASMNQAAQVFNSQLRDLCQQLRGQMK...

XP_057790372.1
MTSILCSRKAVMFNFGDSNSDTGGLAAAMGYEFGYPDGRAFFHRPTGRLCDGRLIIDFLCENVKSNYLSPYLESVEPDFSNGANFAIAGSATLPRYVAFSLSVQILEFRRFRNHSLQLQSKGHVVGEDDFKNGLYMIDIGQNDLTAAFNNVPYDQVLEKIPSFISEIKDAMWSIYLTGGKKLWVHNTGPLGCLPEKLGTLKPTASQVDEHGCVASMNQAAQVFNSQLRDLCQQLRGQMKDSTIVYVDVYSIKYSLIANSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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