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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000191`

染色体: Chr01 坐标: 3280199-3282033 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000191`
名称	SmilChr01G000191
描述	exopolygalacturonase clone GBGE184-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3280199 - 3282033 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007295`
GeneID	`131007295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007295`
原始查询	`LOC131007295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exopolygalacturonase clone GBGE184-like
产物	exopolygalacturonase clone GBGE184-like
Arabidopsis	`AT1G02790` (PGA4) polygalacturonase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839391] identity=42.8; qcov=0.958; evalue=7.43e-97; confidence=medium
Rice	`Os01g0517500` (OsPGL3) - identity=41; qcov=0.891; evalue=5.55e-89; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790421.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057790421.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790421.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790421.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3280513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:3280542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:3280552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:3280589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:3280636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr1:3281278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:3281322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790421.1

403 aa

202

403

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 42-277 aa PF00295 Glyco_hydro_28 67-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790421.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	42	277	7.2e-10	39.7	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057790421.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	67	378	9.7e-84	281.9	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934438.1
AACAATAAAATAATAGAACAAATAAAGTAGAATAAAATTTCGTGAATAAGAATATATATGGCTAATTCTCTGCATATGATGGGTTCCCTGGTCTTAGGCATAAGCTGTTTGATCATCATCAATGCCATCGCCGCCGCTGGCGAACAACGCCGCCTCTTGCAGACTGAGACTGTTTACGACATCACCAAATACGGCGCCAAGGGCGATGGCTCCACCGATGATGCAATGTCGTTGATTCAGGCATGGAGGGCGGGATGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007295
ATGGCTAATTCTCTGCATATGATGGGTTCCCTGGTCTTAGGCATAAGCTGTTTGATCATCATCAATGCCATCGCCGCCGCTGGCGAACAACGCCGCCTCTTGCAGACTGAGACTGTTTACGACATCACCAAATACGGCGCCAAGGGCGATGGCTCCACCGATGATGCAATGTCGTTGATTCAGGCATGGAGGGCGGGATGCGACGGCTCGGCACCGGCAAAGATCGTTGTGCCGCCGGGCAAATTCATGATGGGGGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790421.1
MANSLHMMGSLVLGISCLIIINAIAAAGEQRRLLQTETVYDITKYGAKGDGSTDDAMSLIQAWRAGCDGSAPAKIVVPPGKFMMGEVVLTGPCKAPPPVLIDIQGTILANPDPSSYSNMMWILIEHVNNVKISGGGTLDAQGTNAWKYAKEDQHMPVSFTFQSSLNGDISNLKFLNAMGFHSKLIDSENIKVTKMTITAPEESPNTDGIHLSNATNVEITDTVIGTGDDCISIGTGSKNILVKNVKCGPGHGLAVGSLGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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