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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001276`

染色体: Chr02 坐标: 23403934-23411765 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001276`
名称	SmilChr02G001276
描述	autophagy-related protein 18f
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23403934 - 23411765 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008159`
GeneID	`131008159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008159`
原始查询	`LOC131008159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 18f
产物	autophagy-related protein 18f
Arabidopsis	`AT5G54730` (G18F) autophagy 18 F-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835562] identity=44.8; qcov=0.823; evalue=7.36e-171; confidence=medium
Rice	`Os01g0786900` (OsATG18e) - identity=45.4; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006914 (autophagy); GO:0042594 (response to starvation)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF12490 (BCAS3); PF21034 (BCAS3_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791035.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791035.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791035.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791035.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23404899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:23407646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B26
`Chr2:23407685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:23407826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr2:23408370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:23408489`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr2:23408489`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr2:23409324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:23409398`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr2:23409398`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr2:23409492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B95
`Chr2:23409544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791035.1

906 aa

453

906

BCAS3_WD40

WD40

BCAS3

PF21034 BCAS3_WD40 94-508 aa PF00400 WD40 410-437 aa PF12490 BCAS3 627-764 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791035.1`	Pfam	`PF21034`	BCAS3_WD40	Repeat	94	508	1.8e-59	202.3	BCAS3, WD40 repeat
`XP_057791035.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	410	437	6.5e-06	27.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057791035.1`	Pfam	`PF12490`	BCAS3	Domain	627	764	4e-40	138.0	BCAS3 microtubule associated cell migration factor, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935052.1
CCACGTGTCGTGATCGGAATCACCGGTGCACGCCACTCGCGTGGAACGATCCGTATATTACCGTTTTACCGACAAGGCAGTGAAACTGGGGTTTTGACCGTGGTGGGGGAAAACAGGAGAAGACGTGCGGCGGAGTTGTCTTCTGCTCAACTCTTCAAATTTCCGATTAAAAAGAAATTCGAAAATCGAATTAAGAGAGAGAGACGTAAGACAGAGAGTCATCTTTTTATTTCTTCACATCTATTCATTATCCGATGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008159
ATGATCATTAGAGTGGTGAGGGGGCTGAGCATCTGTGCGTGGTGTGTCGTTTCGGGGATTGGTTTTTTAGGGTTGTTTCCGTTGGTTGTTCCATTGGGGATGAGGAATGATAGCCAGAAAAGTGGTGATGGTGGATCAGTGGTGCCAAGGGGTAGAGTCAATAACGGTATACTTCCAAATTCGTTTAGGGCTTTTTCGAGCTACCTGAAGATTGTTTCCTCTGGTGCATCCACCGTTGCCTCCACTGTGAGGTCTGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791035.1
MIIRVVRGLSICAWCVVSGIGFLGLFPLVVPLGMRNDSQKSGDGGSVVPRGRVNNGILPNSFRAFSSYLKIVSSGASTVASTVRSAASAASAIVERDGDTSHDQVSWAGFDKLELEKGNLRRVLLLGFSYGFQIWDVEAADNVHNIVSRHDGPVSFMQVLPKPLASNQSGDKFADSRPLLVICADGSFSGDINDHEGSVLTNGMVQQFNGSVNGTCMPTVVWFYSFKSQSYVHLLRFRSVVHLVRCSSRVVAVLQSNQIH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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