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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002283`

染色体: Chr02 坐标: 40302012-40303908 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002283`
名称	SmilChr02G002283
描述	probable histone H2A.3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40302012 - 40303908 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008449`
GeneID	`131008449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008449`
原始查询	`LOC131008449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable histone H2A.3
产物	probable histone H2A.3
Arabidopsis	`AT4G27230` (HTA2) histone H2A 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828831] identity=74.2; qcov=0.614; evalue=2.64e-45; confidence=medium
Rice	`Os07g0545400` - identity=71.1; qcov=0.614; evalue=1.71e-43; confidence=medium
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00125 (Histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791310.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791310.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791310.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791310.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40302034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D1
`Chr2:40302036`	`T`	`TG`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	D9
`Chr2:40302036`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr2:40302043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C61
`Chr2:40302045`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr2:40302045`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr2:40302048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,D9
`Chr2:40302052`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B137,C62,D8
`Chr2:40302052`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B137,C62,D8
`Chr2:40302064`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B61,D9
`Chr2:40302064`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B61,D9
`Chr2:40302068`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B61,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791310.1

158 aa

158

Histone

PF00125 Histone 68-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791310.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	68	140	3.9e-08	34.3	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935327.1
ATGCGAGTATACATCGGGATCTCTTATTTCGGCATAGACCCTTTTTATCGATGCCAAGTCCCGCGTCTTGGAGTAGAAGGAAAGCAGGGCATTGGCAACGTGGGAAAAACTTTGAAGGGCGGATTTAACGCAGAGGGCGTGGAGTTGAACGCCCACTCTGATTTGGCGGGAGTTGGCGCAGGCGTCGTTGGCTTCTCCGTTTCTCAAAACAGAAAGGGCGGGCTTCAGTTTCCCGTCGATCGCATCGCCCGTTTTCTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008449
ATGCGAGTATACATCGGGATCTCTTATTTCGGCATAGACCCTTTTTATCGATGCCAAGTCCCGCGTCTTGGAGTAGAAGGAAAGCAGGGCATTGGCAACGTGGGAAAAACTTTGAAGGGCGGATTTAACGCAGAGGGCGTGGAGTTGAACGCCCACTCTGATTTGGCGGGAGTTGGCGCAGGCGTCGTTGGCTTCTCCGTTTCTCAAAACAGAAAGGGCGGGCTTCAGTTTCCCGTCGATCGCATCGCCCGTTTTCTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791310.1
MRVYIGISYFGIDPFYRCQVPRLGVEGKQGIGNVGKTLKGGFNAEGVELNAHSDLAGVGAGVVGFSVSQNRKGGLQFPVDRIARFLKAEKYVERVGVGAPVYLVVVLEYLVIEVLELADNDAKDNKKTRTVPRHIHLAVRNDEELSKLLGDVMIEISC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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