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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002306`

染色体: Chr02 坐标: 40684245-40687671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002306`
名称	SmilChr02G002306
描述	uncharacterized SmilChr02G002306
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40684245 - 40687671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008456`
GeneID	`131008456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008456`
原始查询	`LOC131008456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0627900` - identity=47.3; qcov=0.841; evalue=1.86e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791315.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791315.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791315.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791315.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40684247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B110,C80,D10
`Chr2:40684253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B39,B65,B77,C6
`Chr2:40684256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:40684259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,C22,C66,C81
`Chr2:40684263`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A2,B102,B103,B109,B120,B17,B29,B4,B74,B81,B89,B9,B91,C20,C38,C39
`Chr2:40684272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	127	A1,A14,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,B1,B100,B101,B104,B105,B106,B107,B11,B110,B114,B12,B124,B127,B128,B130,B131,B133,B137,B138,B139,B14,B16,B18,B19,B21,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B4,B41,B42,B43,B46,B49,B50,B51,B53,B55,B57,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B69,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B90,B92,B94,C11,C12,C15,C16,C2,C21,C23,C24,C27,C28,C30,C32,C33,C34,C37,C38,C41,C50,C53,C54,C55,C56,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C71,C72,C76,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,D1,D2,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr2:40684280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B128,B30,B64,C19
`Chr2:40684294`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B101,B13,B95,C43
`Chr2:40684294`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B101,B13,B95,C43
`Chr2:40684297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B113,B114,B139,B28,B39,B48,B65,B77,B94,C29,C45,C52,C6,C64,C67,D11
`Chr2:40684311`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	170	A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A9,B10,B100,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B129,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B26,B29,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B48,B49,B51,B52,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B67,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B99,C1,C11,C14,C16,C18,C19,C20,C23,C24,C26,C27,C30,C31,C32,C34,C36,C37,C38,C40,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D10,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr2:40684314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	189	A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A7,A9,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B26,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B48,B49,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B99,C1,C11,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C23,C24,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C40,C42,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D10,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791315.1

239 aa

120

239

SH3_Tf2-1

PF24626 SH3_Tf2-1 69-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791315.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	69	134	2.9e-25	88.9	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935332.1
ATGGCTCCCTACGAGGCACTGTATGGACGAAAATGCAGATCACCCCTTTTCTGGGATGAAGTGGGTGAACGAAAACTGCTGGGACCAGAACTAGTTCAACAAATGATCGAGAAAGTTGACCAGGTCAAACAGAAGATCAAGGAAGCACAAGACAGGCAAAAGTCATATGCCGATACACGACGCACTGAACTAGAATTCAACACGGGGGCTCGAGTTTTTCTCAAAATCTCCCCCACAAAGGGAGTAATCCATTTTGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008456
ATGGCTCCCTACGAGGCACTGTATGGACGAAAATGCAGATCACCCCTTTTCTGGGATGAAGTGGGTGAACGAAAACTGCTGGGACCAGAACTAGTTCAACAAATGATCGAGAAAGTTGACCAGGTCAAACAGAAGATCAAGGAAGCACAAGACAGGCAAAAGTCATATGCCGATACACGACGCACTGAACTAGAATTCAACACGGGGGCTCGAGTTTTTCTCAAAATCTCCCCCACAAAGGGAGTAATCCATTTTGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791315.1
MAPYEALYGRKCRSPLFWDEVGERKLLGPELVQQMIEKVDQVKQKIKEAQDRQKSYADTRRTELEFNTGARVFLKISPTKGVIHFGSRGKLRPRYIGPFEILNRVGKVAYRLALPPSIGDVHNVFHVSQLQKYVFDPKHVVKHEKVVLAQDLSYEEKPVQILDRKVQVLRNKQIPMVKVLWHHHRIEEATWELEEKMRAQYPELDYQGLVARWVDRHRALTDLERYEGGCLIGGYPEHN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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