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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002679`

染色体: Chr01 坐标: 44995205-44996275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002679`
名称	SmilChr01G002679
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44995205 - 44996275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008682`
GeneID	`131008682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008682`
原始查询	`LOC131008682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
产物	loganic acid O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G68040` (AT1G68040) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843132] identity=49.5; qcov=0.878; evalue=2.09e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0701700` - identity=40.1; qcov=0.923; evalue=1.21e-41; confidence=medium
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791656.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791656.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791656.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791656.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44995259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:44995279`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B105,B118,B16,B18,B32,B9,B97
`Chr1:44995287`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B105,B118,B16,B18,B32,B9,B97
`Chr1:44995296`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A5,B101,B103,B115,B51,B71,B91,C51
`Chr1:44995318`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A21,A9,B14,B79
`Chr1:44995318`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A21,A9,B14,B79
`Chr1:44995337`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B105,B118,B16,B18,B32,B9,B97
`Chr1:44995340`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B105,B118,B16,B18,B32,B9,B97,C38,C63
`Chr1:44995376`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,A9,B14,B23,B79,B9
`Chr1:44995412`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B112,B140,B19,B6,B80,B91,C22,C80,D5
`Chr1:44995423`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	B25,B28,B45,B77,B8,B84,C17,C50,C52,C72,C76,C87
`Chr1:44995482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,C10,C36,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791656.1

246 aa

123

246

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 5-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791656.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	5	236	2.6e-78	264.3	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935673.1
TTTTATGTTTCTTTGTGTCAAGTAGTGAATGAGCTGGAGATTCCTATTCTCAATGAATTAACATAATTAATAATAACACAGTCAATCTTCTGATTCTATATATACAATATCGAGAAATGTGATTTAATATCAATCATCACTTAATCATTAATTTTTTCATAGTAATTTCAGGAAATTAAACGATAAATCAATATAGGAGTACTAGTATAATGGCTGAATCTGCTTGCCCAATGAATGGTGGTGACGGCACGTATAGCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008682
ATGGCTGAATCTGCTTGCCCAATGAATGGTGGTGACGGCACGTATAGCTACAGCAAGAACTCCACTTGGCAGAGATCTGGTGCAAGTGCTGTGAAGGATTTAATAAATGAGGCGTTGACGGAGAATCTTGAGATAGACAAGCTGTTATGTGGTTCGAAGAGATTCGCCGTCGCCGATTTAGGTTGTTCGGTGGGGCCCAACACATTCTACTCCATGGAATCCATCATCGAAGCCGTACAGCAAAAGTCGTCTCCTAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791656.1
MAESACPMNGGDGTYSYSKNSTWQRSGASAVKDLINEALTENLEIDKLLCGSKRFAVADLGCSVGPNTFYSMESIIEAVQQKSSPKKLEFQVLFNDQIGNDFNTLFASLPRERNYFAAAVAGSFYGRLFPSSSIHIAYSSAALHWLSKVPEEGSPAWNAGKIHYNGASDAVVRAYEEQFEEEMEIFLRCRAEEIVAGGIMVINMPGVPHRDVPHRAAVMLSFIESILIDMVKEVCTSTSYYLHFLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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