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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004785`

染色体: Chr02 坐标: 70018605-70021442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004785`
名称	SmilChr02G004785
描述	isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70018605 - 70021442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008777`
GeneID	`131008777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008777`
原始查询	`LOC131008777`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 1
产物	isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 1
Arabidopsis	`AT5G08100` (ASPGA1) N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830704] identity=76.3; qcov=0.991; evalue=7.05e-176; confidence=high
Rice	`Os03g0597600` (OsASNase1) - identity=71.3; qcov=1; evalue=4.54e-161; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00460 (Cyanoamino acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01112 (Asparaginase_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791785.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791785.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791785.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791785.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791785.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70018850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C17
`Chr2:70018900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:70020256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr2:70020945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B15,C45
`Chr2:70021044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C60
`Chr2:70021128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C34,C84
`Chr2:70021132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:70021155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B12,D1
`Chr2:70021192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:70021206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791785.1

320 aa

160

320

Asparaginase_2

PF01112 Asparaginase_2 1-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791785.1`	Pfam	`PF01112`	Asparaginase_2	Domain	1	313	4.4e-117	391.4	Asparaginase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935802.1
AAAAAGAAAGGAAGATGTCTCAATCATGGAGATGTCCGTCCGTCCAATAAAAACAAAAGGAATCTAGTAACTGCTCCCAATATTACGCAGAAGATGCTCATACTGCTCTGCTCTACCTACTAGCTCGCTGCGGAATGGGTTGGGCTATCGCACTGCACGGCGGCGGCGGTGAAATCCCCCGCTCATTGCCGCCGGAGCGCATCCAGCCCCGAGAAGAAGCCCTCCGCCACTCTCTGCAGGTCGGCGTCGCCGCTATTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008777
ATGGGTTGGGCTATCGCACTGCACGGCGGCGGCGGTGAAATCCCCCGCTCATTGCCGCCGGAGCGCATCCAGCCCCGAGAAGAAGCCCTCCGCCACTCTCTGCAGGTCGGCGTCGCCGCTATTAAAGCTGGTCGATCACCACTCGATGTCGTCGAACTCGTCGTTCGCGAATTGGAAGACCATCCACTCTTTAATGCGGGGAGAGGGTCTGTCTTGACAAGCAACGGGACGGTGGAAATGGAGGCTTGTATCATGGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791785.1
MGWAIALHGGGGEIPRSLPPERIQPREEALRHSLQVGVAAIKAGRSPLDVVELVVRELEDHPLFNAGRGSVLTSNGTVEMEACIMDGNTKRCGAVSGLTTVKNAISLARLVMEKTPHIYLGFDGAEAFARDQGVETIDSSHFITPENIERLKQAKEANRVQIDYTEPLTKVEEASPPNGDSQLGTVGCVAVDGNGNLATATSTGGLVNKMAGRIGDTPIIGAGTYANKLCAVSATGKGESIIRATVARDVAALMEYKGLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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