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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004823`

染色体: Chr02 坐标: 70334940-70338741 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004823`
名称	SmilChr02G004823
描述	ATP synthase subunit gamma, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70334940 - 70338741 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008815`
GeneID	`131008815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008815`
原始查询	`LOC131008815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase subunit gamma, mitochondrial
产物	ATP synthase subunit gamma%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G33040` (ATP3) gamma subunit of Mt ATP synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817866] identity=79.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0320400` - identity=75.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis); GO:0045261 (GO:0045261); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00231 (ATP-synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057791853.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057791853.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057791853.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057791853.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70335494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:70335794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:70335948`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B129,C20,C37
`Chr2:70335948`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B129,C20,C37
`Chr2:70336017`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A19,B11,B112,B12,B121,B134,B136,B137,B138,B14,B16,B44,B50,B54,B58,B69,B73,B77,B86,B9,C18,C2,C4,C44,C51,C56,C64,C66,C68,C70,C79,C84,C86,C9,D8
`Chr2:70336038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B23,B7,C1,D10
`Chr2:70336047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B69,B85,C59
`Chr2:70336267`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A13
`Chr2:70336267`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A13
`Chr2:70336435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr2:70336901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr2:70338435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B107,B130,B135,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791853.1

324 aa

162

324

ATP-synt

PF00231 ATP-synt 47-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791853.1`	Pfam	`PF00231`	ATP-synt	Domain	47	322	1.6e-76	258.5	ATP synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935870.1
TTTGAATTATTAATATCGATAAAAATTAATATTACATCAATTCAATCTCAAATAATCTCGAGTTTAATCTCAGGTCAACTTAAAACGCTTACTGATTATTGATTATAGATATAGTCATTTTCAGTCTCCGCCTCGCCCACCACTTCCAATTTCAAGCAGCTGAGCGAAACCCTAGAGCTCGCGTTGTCCGATCCCCAATCAGAAGCAGAGTGTTGTACCCAGATCTGATTTTGAAGAGTTGCAAATGGCGATGGCTGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008815
ATGGCGATGGCTGCGCTGAGACGCGAGGGCAGGCGGATTGCTGCCCCTATAATTTCTCCCCGCCCTATCAATCCCCTCCGCTCGTCTATCGTTCCTTCCGAGGATCAATCTTTCTTGGGAGTTCGTTCTGTGTCAACTCAAATTGTCCGCAATCGTATGAAGAGTGTTAAGAATATTCAAAAAATCACAAAGGCTATGAAGATGGTTGCAGCTTCAAAGCTCCGAGCTATTCAGTCTAAAGCTGAAAACTCGCGTGGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791853.1
MAMAALRREGRRIAAPIISPRPINPLRSSIVPSEDQSFLGVRSVSTQIVRNRMKSVKNIQKITKAMKMVAASKLRAIQSKAENSRGLWQPFTALLGDLPSVDVKKTVVVTISSDKGLCGGINSTSVKVSRGLRKLNSGPDKECKFVILGEKAKAQLVRDSKKDIELALTELQKNPLNYTQVAVLADDILKNVEYDALRIVYNKFQSVVSFIPSTSTVLSPEIVERESEAGGKLGELDAYEVEGAETKSEVLQNLTEFQFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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