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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005583`

染色体: Chr02 坐标: 75650735-75651785 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005583`
名称	SmilChr02G005583
描述	chlorophyll a-b binding protein 37, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75650735 - 75651785 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009548`
GeneID	`131009548`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009548`
原始查询	`LOC131009548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyll a-b binding protein 37, chloroplastic-like
产物	chlorophyll a-b binding protein 37%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G05100` (LHCB2.1) photosystem II light harvesting complex protein 2.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815058] identity=89.1; qcov=1; evalue=6.78e-180; confidence=high
Rice	`Os03g0592500` (LHCB) - identity=87.2; qcov=1; evalue=1.62e-172; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009768 (photosynthesis, light harvesting in photosystem I); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0010287 (plastoglobule)
KEGG	smil00196 (Photosynthesis - antenna proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00504 (Chloroa_b-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009548

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792937.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057792937.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057792937.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792937.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75651058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B101,B37,C55
`Chr2:75651071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:75651073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B31,C60
`Chr2:75651334`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	131	A13,A14,A16,A2,A20,A25,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B103,B108,B110,B111,B112,B114,B118,B119,B120,B122,B125,B126,B128,B131,B132,B133,B135,B139,B14,B15,B18,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B35,B36,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B59,B63,B64,B67,B69,B70,B71,B72,B74,B77,B79,B81,B82,B84,B85,B86,B89,B91,B95,B98,C10,C12,C14,C16,C2,C20,C23,C24,C25,C26,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C43,C45,C47,C49,C50,C52,C53,C54,C57,C58,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C7,C72,C73,C75,C76,C77,C8,C80,C82,C84,C85,C86,C87,D1,D2,D5,D8,D9
`Chr2:75651359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:75651373`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A13,A14,A16,A20,A6,A7,B10,B100,B103,B110,B112,B114,B115,B118,B119,B120,B122,B126,B128,B132,B133,B135,B139,B14,B15,B18,B21,B22,B26,B29,B3,B30,B36,B4,B40,B41,B46,B59,B63,B67,B68,B71,B72,B74,B77,B82,B83,B85,B86,B91,B95,C12,C14,C16,C24,C25,C26,C28,C31,C34,C35,C38,C43,C47,C49,C50,C52,C53,C54,C57,C59,C6,C62,C64,C65,C66,C7,C71,C72,C73,C76,C80,C84,C86,D1,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792937.1

265 aa

132

265

Chloroa_b-bind

PF00504 Chloroa_b-bind 66-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792937.1`	Pfam	`PF00504`	Chloroa_b-bind	Family	66	231	2.6e-51	175.1	Chlorophyll A-B binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936954.1
CATTAACTCCTACCCCATCACAACAACAACTAACTTCCCAACAGCTTAAACTAGAAAGAGTTTTGAGGCAAAAATGGCAACTTCAGCAATCCAACAATCTGCATTTGCCGGCCAGGCAGCGCTCAAGCCACAGAATGAGCTCGCCCGCAAGGTCGGTAACGTCGGAGGCGGCCGCTTCACCATGAGGCGTACCATCAAGAGCTCTCCCCAAAGCATCTGGTACGGACCAGACAGGCCCAAATACTTGGGCCCATTCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009548
ATGGCAACTTCAGCAATCCAACAATCTGCATTTGCCGGCCAGGCAGCGCTCAAGCCACAGAATGAGCTCGCCCGCAAGGTCGGTAACGTCGGAGGCGGCCGCTTCACCATGAGGCGTACCATCAAGAGCTCTCCCCAAAGCATCTGGTACGGACCAGACAGGCCCAAATACTTGGGCCCATTCTCCGAGCAGACCCCATCGTACCTCACCGGGGAATTCCCCGGTGACTACGGCTGGGACCCTGCAGGACTCTCGGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792937.1
MATSAIQQSAFAGQAALKPQNELARKVGNVGGGRFTMRRTIKSSPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDPAGLSADPETFARNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSKNGIKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWASQVVLMGLIEGYRVGGGPLGEGLDKVYPGGAFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLYDHVADPVANNAWAFATN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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