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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003042`

染色体: Chr02 坐标: 51167902-51169515 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003042`
名称	SmilChr02G003042
描述	beta-amyrin 6-beta-monooxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51167902 - 51169515 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009691`
GeneID	`131009691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009691`
原始查询	`LOC131009691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amyrin 6-beta-monooxygenase-like
产物	beta-amyrin 6-beta-monooxygenase-like
Arabidopsis	`AT5G36110` (CYP716A1) cytochrome P450, family 716, subfamily A, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833607] identity=39.5; qcov=0.972; evalue=3.66e-98; confidence=medium
Rice	`Os07g0518500` (OSJNBa0036M16.135-2) - identity=31.5; qcov=1; evalue=5.26e-56; confidence=low
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00999 (Biosynthesis of various plant secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793086.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057793086.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793086.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793086.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51167982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A19,A24,A9,B113,B114,B117,B12,B129,B137,B18,B22,B24,B29,B3,B31,B37,B41,B48,B6,B66,B68,B71,B73,B86,B98,C19,C22,C36,C4,C40,C41,C62,C64,C66,C67,C78,C8,C81,D7
`Chr2:51168061`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	99	A10,A18,A2,A21,A22,A25,A3,A4,A7,B1,B10,B103,B105,B107,B113,B114,B120,B122,B124,B127,B128,B129,B13,B132,B133,B134,B135,B14,B15,B23,B24,B3,B30,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B45,B51,B56,B58,B60,B63,B64,B67,B70,B75,B77,B81,B82,B83,B91,B94,B96,C1,C10,C11,C14,C18,C24,C25,C28,C3,C30,C32,C33,C34,C37,C40,C42,C48,C49,C51,C56,C57,C58,C60,C61,C64,C66,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C83,C87,C9,D11,D4,D5,D8
`Chr2:51168070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B47,C31
`Chr2:51168081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:51168162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B47,C31,D10
`Chr2:51168163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B95,C14,C83
`Chr2:51168213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A16,B102,B118,B120,B128,B129,B14,B16,B17,B20,B26,B32,B34,B38,B39,B58,B59,B6,B62,B65,B67,B70,B75,B77,B78,B90,B92,B93,B97,C11,C13,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C22,C26,C35,C37,C40,C42,C59,C69,C70,C73,C79,C82,C84,C85,C9,D3,D6,D8
`Chr2:51168264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:51168297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr2:51168311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:51168348`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	56	A10,A18,A2,A22,A25,A3,B1,B103,B105,B107,B113,B128,B13,B132,B133,B134,B135,B15,B23,B24,B30,B38,B4,B42,B43,B45,B51,B60,B63,B64,B70,B91,B96,C10,C14,C18,C28,C30,C32,C48,C49,C51,C57,C58,C60,C61,C64,C66,C68,C71,C72,C73,C76,C87,D11,D4
`Chr2:51168439`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793086.1

427 aa

214

427

p450

PF00067 p450 147-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793086.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	147	381	1.6e-34	120.2	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937103.1
CTTTGTCAGGCTTTTCGAAATTCGTCAAGGATAGAATGGTGAAATACTCTCCCGATGCATTCAGCACCTCATTGTTGGGACAGAATCTAGTGGTTTTCTGCGGCGCGCAAGGCAACAAGTTTGTTTTCAGCAACGATGATAAACTCACCACCCACTGGTTGCCTCCATCGACCCTTAAGGTTCTGTTCCCGGGAATCGGGGGGAACCAATATAAGGAAACCGTAGCCTTGTTCCACAAATTCCAGTACGAGATTCTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009691
ATGGTGAAATACTCTCCCGATGCATTCAGCACCTCATTGTTGGGACAGAATCTAGTGGTTTTCTGCGGCGCGCAAGGCAACAAGTTTGTTTTCAGCAACGATGATAAACTCACCACCCACTGGTTGCCTCCATCGACCCTTAAGGTTCTGTTCCCGGGAATCGGGGGGAACCAATATAAGGAAACCGTAGCCTTGTTCCACAAATTCCAGTACGAGATTCTCAAGCCGGATGCCCTGAGACAGTACATACCGGTGATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793086.1
MVKYSPDAFSTSLLGQNLVVFCGAQGNKFVFSNDDKLTTHWLPPSTLKVLFPGIGGNQYKETVALFHKFQYEILKPDALRQYIPVMDSLAREQLRNPSSVVKALPLARKGRVFVDEVDPERLHKLLEPFSRLTVGLLALPINLPGTTFNRGLRGGKVVQGGLMRIVEERRRKDSQGRDCLLSKLLIDEDAKYMSDIKIANFLIGVLLASYDTTAYALIVVIWSIILLNFHIFINKFLKLRIGSSLFAQQMAIAKSKGADE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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