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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003333`

染色体: Chr02 坐标: 54573091-54575379 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003333`
名称	SmilChr02G003333
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54573091 - 54575379 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009753`
GeneID	`131009753`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009753`
原始查询	`LOC131009753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 1-like
产物	mannan endo-1%2C4-beta-mannosidase 1-like
Arabidopsis	`AT5G66460` (MAN7) Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836778] identity=50.2; qcov=0.906; evalue=4.9e-151; confidence=high
Rice	`Os01g0663300` - identity=50.6; qcov=0.886; evalue=4.83e-143; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0071704 (GO:0071704)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00150 (Cellulase); PF26410 (GH5_mannosidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009753

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057793145.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057793145.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057793145.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793145.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793145.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54573190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C34,C71
`Chr2:54573262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B42,B43,B95,C83
`Chr2:54573277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C34,C71
`Chr2:54573285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C34,C71
`Chr2:54573291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B31
`Chr2:54573291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:54573389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B136,B139,D11
`Chr2:54573511`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B109
`Chr2:54573511`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B109
`Chr2:54573567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:54573668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:54573680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793145.1

446 aa

223

446

GH5_mannosidase

Cellulase

PF26410 GH5_mannosidase 34-367 aa PF00150 Cellulase 47-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793145.1`	Pfam	`PF26410`	GH5_mannosidase	Domain	34	367	6.3e-49	167.6	GH family 5 beta-mannosidase-like
`XP_057793145.1`	Pfam	`PF00150`	Cellulase	Domain	47	335	3.1e-16	60.4	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937162.1
ATGACTTCCATTGGAACTTCAAGTTCGATAGTTGGTATGTTTATGTTATTGGGAGCTGTTGTTGTCTGCCAAGGCGGCAGGGTTCCCTTAAACCAAGCTAATTTTGTAAGAACAAGTGAATCCCATTTCCTTCTCCAAGGATCGCCATTTCTGTTCAATGGCTTCAATTCGTATTGGATGATGCACGTGGCCGCCGACCCCAACGACCGCCACAAGGTCTCAGACGTCTTCAGCCAAGCCTCCGCCGCGGGGCTCACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009753
ATGACTTCCATTGGAACTTCAAGTTCGATAGTTGGTATGTTTATGTTATTGGGAGCTGTTGTTGTCTGCCAAGGCGGCAGGGTTCCCTTAAACCAAGCTAATTTTGTAAGAACAAGTGAATCCCATTTCCTTCTCCAAGGATCGCCATTTCTGTTCAATGGCTTCAATTCGTATTGGATGATGCACGTGGCCGCCGACCCCAACGACCGCCACAAGGTCTCAGACGTCTTCAGCCAAGCCTCCGCCGCGGGGCTCACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793145.1
MTSIGTSSSIVGMFMLLGAVVVCQGGRVPLNQANFVRTSESHFLLQGSPFLFNGFNSYWMMHVAADPNDRHKVSDVFSQASAAGLTVCRTWAFGDGGDGALQISPGTYDERVFQGLDFVISEARKYGIRLILSFVNNYNDFGGKAQYAEWARNAGAQVNGDDDFYTNPLIKDYYKNHIRRVVTRMNSITRVGYKDEPTIMAWELMNEPRCKADYSGKTLNGWVEEMASFVKLIDNNHLVEIGMEGFYGDSMPERKQVNPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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