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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003491`

染色体: Chr01 坐标: 53457578-53460167 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003491`
名称	SmilChr01G003491
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53457578 - 53460167 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009989`
GeneID	`131009989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009989`
原始查询	`LOC131009989`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=42.5; qcov=0.921; evalue=2.34e-85; confidence=medium
Rice	`Os02g0215700` - identity=43.7; qcov=0.906; evalue=2.18e-89; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793370.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793370.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793370.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793370.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53457880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C28
`Chr1:53457905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:53458260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:53459363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr1:53459411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A16,A22,B126,B42,B43,B50,B86,B88,C11,C37,C44,C69,C70,C85,C87
`Chr1:53459421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C19,C82
`Chr1:53459423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B121,B136,B66,B7,B90,C24,C27,C3,C36,C46,C50,C84
`Chr1:53459429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B78,B96,C5
`Chr1:53459433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C82
`Chr1:53459442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B47,B92,C16
`Chr1:53459447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B137,B34
`Chr1:53459484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793370.1

404 aa

202

404

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 128-282 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 130-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793370.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	128	282	1.4e-21	77.8	Protein kinase domain
`XP_057793370.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	130	286	6.7e-24	85.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937387.1
ATGTTGCAGCAAACTTTGAAGATATTGCTGCAATGGTTGAAGTTTGCTTTGAACCTTTCGTTCAATGATCTTGAAGGCGCGTTGCCTCAAGGTGGTGTGTTCAAGAATGCAAGCGCAATTTCAGTAGCCGGGAACCCTAAGCTCTGCGGAGGCGTGCCTGAGCTCAGACTACCAAAATGCAATCTCAAGAAGTCGAACTTGAAGTTGAAGATAGTGATGATCTCTACTACAATATTAGCATTAGCTATCATTGTTGGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009989
ATGTTGCAGCAAACTTTGAAGATATTGCTGCAATGGTTGAAGTTTGCTTTGAACCTTTCGTTCAATGATCTTGAAGGCGCGTTGCCTCAAGGTGGTGTGTTCAAGAATGCAAGCGCAATTTCAGTAGCCGGGAACCCTAAGCTCTGCGGAGGCGTGCCTGAGCTCAGACTACCAAAATGCAATCTCAAGAAGTCGAACTTGAAGTTGAAGATAGTGATGATCTCTACTACAATATTAGCATTAGCTATCATTGTTGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793370.1
MLQQTLKILLQWLKFALNLSFNDLEGALPQGGVFKNASAISVAGNPKLCGGVPELRLPKCNLKKSNLKLKIVMISTTILALAIIVGGALVFCCLKRRRPPPPSNPFANPLLQVSYQTLSQATVGFSEEILLGAGSYGAVYRGALGEDEKLVTVKVLNLSQRGAVRSFVAECEALRNIRHGNLVKVVTACSDFDMQGNDLKALVYEFMPNGSLDDWLHEEDQRRGRARRLGLAQRVSIAIDVACALDPIIHCDIKPSNVLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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