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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003412`

染色体: Chr02 坐标: 55283408-55290154 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003412`
名称	SmilChr02G003412
描述	uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55283408 - 55290154 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010361`
GeneID	`131010361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010361`
原始查询	`LOC131010361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic
产物	uroporphyrinogen-III synthase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G26540` (HEMD) uroporphyrinogen-III synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817195] identity=62.3; qcov=0.808; evalue=2.58e-108; confidence=high
Rice	`Os03g0186100` (UROS) - identity=57.5; qcov=0.858; evalue=1.56e-104; confidence=high
GO	GO:0004852 (uroporphyrinogen-III synthase activity); GO:0006780 (uroporphyrinogen III biosynthetic process); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02602 (HEM4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793838.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057793838.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793838.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793838.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55283531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C22,C70
`Chr2:55284732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B71,B82,C62
`Chr2:55287005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:55287022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:55288026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B71,B82,C62
`Chr2:55288960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C70
`Chr2:55289226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793838.1

302 aa

151

302

HEM4

PF02602 HEM4 64-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793838.1`	Pfam	`PF02602`	HEM4	Family	64	286	2.1e-38	132.5	Uroporphyrinogen-III synthase HemD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096532.1
CGGTACGCTTTAACTGAAGCCACGAACCGATTTTCTTATTGAAAAGATTATGCAAACACCCTCCGACTCATGGCTAAAACCTCTCTCTCCACATTCTCCCCGATCTCTCCCCGTCTACTTCGCTGCTCTCCGTCTTTGTCTTCTTCTTGCCAGTTTAAGAACAGAAGAATTTTCCTTAACATCGTTAATTTGTCAGCTTCTACGTCTCCTTCAAATCCTAAAGTTGTTGTCACAAGAGAGCGCGGCAAAAATGGCAGACT...

XM_057937855.1
CCGAGAGAGCACGGTACGCTTTAACTGAAGCCACGAACCGATTTTCTTATTGAAAAGATTATGCAAACACCCTCCGACTCATGGCTAAAACCTCTCTCTCCACATTCTCCCCGATCTCTCCCCGTCTACTTCGCTGCTCTCCGTCTTTGTCTTCTTCTTGCCAGTTTAAGAACAGAAGAATTTTCCTTAACATCGTTAATTTGTCAGCTTCTACGTCTCCTTCAAATCCTAAAGTTGTTGTCACAAGAGAGCGCGGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010361
ATGGCTAAAACCTCTCTCTCCACATTCTCCCCGATCTCTCCCCGTCTACTTCGCTGCTCTCCGTCTTTGTCTTCTTCTTGCCAGTTTAAGAACAGAAGAATTTTCCTTAACATCGTTAATTTGTCAGCTTCTACGTCTCCTTCAAATCCTAAAGTTGTTGTCACAAGAGAGCGCGGCAAAAATGGCAGACTTATTGACGCTTTGGCAAATCGTGGGATTGATTGTCTAGAGCTTCCTCTTGTTCAGCATACTCAGTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793838.1
MAKTSLSTFSPISPRLLRCSPSLSSSCQFKNRRIFLNIVNLSASTSPSNPKVVVTRERGKNGRLIDALANRGIDCLELPLVQHTQLPGFDKLSCLLRSNSFDWIVITSPEAGSVFLDAWTAAGTPNVRIGVVGAGTSSVFGKIQPCLKESLNVAFVPSKAIGKVLTAELPKLGNERCTVLYPASAKASNEIEEGLAKRGFEVTRLNTYTTEPVSHVDQMVLDLALVAPVIAVASPSAVRAWISLIPEGQQWDNAVACIGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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