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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003905`

染色体: Chr02 坐标: 61122350-61126498 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003905`
名称	SmilChr02G003905
描述	UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61122350 - 61126498 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010848`
GeneID	`131010848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010848`
原始查询	`LOC131010848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 2
产物	UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 2
Arabidopsis	`AT4G33330` (PGSIP3) plant glycogenin-like starch initiation protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829469] identity=59.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0184300` - identity=53.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity); GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF28720 (GUX1-5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057794507.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057794507.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794507.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794507.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61122567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:61122589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:61122604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:61122621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:61122729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:61122928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:61122985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B13,B24,B33,C48
`Chr2:61123615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B127
`Chr2:61123723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B122
`Chr2:61123789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:61123831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:61123890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794507.1

582 aa

291

582

GUX1-5_N

Glyco_transf_8

PF28720 GUX1-5_N 97-260 aa PF01501 Glyco_transf_8 297-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794507.1`	Pfam	`PF28720`	GUX1-5_N	Domain	97	260	2.9e-65	220.1	GUX1-5 N-terminal domain
`XP_057794507.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	297	503	1.6e-13	51.6	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938524.1
ATGAATCATGATCAATTGGCATCATCATATAATTTTGAGCACTAAACAAATCACATAGGAGGTTTTTGTATCTTCAAGTCTAGGACAAAAGGGGATAAATTAAGCATTCCCCAAAATAAATAGCATTTTCATGGAAATAACAAAAACCTATAACTCATATTGAAAAAGGCCCTCATTATCTCACCCTTTTTCTCCCAAAGGCAAGAAAACCAACAGTACCCTCTCATTGGTTCCACAAAATTTCCCAAACTCAAAATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010848
ATGGTGTTGAAGAAAATGATAATGACGACTTCTGCAAAATCTCTCATCATAAGAATCAATCTCTTCTTCTTGGCATTCTTCTTCGTCGTCTACGCCACCCTCCTCCTCTACCCCTCCGCCTCCGACTACCACCACCGCGCCGCCTCCTTGGTCCGCTGCTCCCTCCTCGACTGCCATCATAAGATTCAGAGTGAGAAAGGGACGATGATGAAAGCGGTTCTAGAAGATTCCGGGAAGCTGAAACCTAGGAGAGAGCTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794507.1
MVLKKMIMTTSAKSLIIRINLFFLAFFFVVYATLLLYPSASDYHHRAASLVRCSLLDCHHKIQSEKGTMMKAVLEDSGKLKPRRELIKREKPRFLDGGMKIGMINMDDEDVSEWSDYAQIFPVSFEKVPEHFEWKSIFPEWIDEEEEYSGARCPEIPMPDWEEYGYVDVVVAKLPCRRPEEGWSRDVFRLQVHLAAANMAVRRGRRDWGGRTKVVVLSKCPPMPEFFRCEEVAEREGEWWFYRPEMRRLEQKVSLPVGSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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