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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003962`

染色体: Chr02 坐标: 61784089-61785619 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003962`
名称	SmilChr02G003962
描述	uncharacterized SmilChr02G003962
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61784089 - 61785619 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010894`
GeneID	`131010894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010894`
原始查询	`LOC131010894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0225100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0225100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G07900` (AT5G07900) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684] identity=23.7; qcov=0.929; evalue=5.38e-32; confidence=weak
Rice	`Os06g0225100` - identity=30.6; qcov=0.856; evalue=3.21e-40; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794579.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794579.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794579.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794579.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61784279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:61784368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:61784414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:61784453`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr2:61784453`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr2:61784467`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B103,B127
`Chr2:61784467`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B103,B127
`Chr2:61784534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr2:61784689`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A2
`Chr2:61784689`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A2
`Chr2:61784920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B103,B2
`Chr2:61785047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B78,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794579.1

382 aa

191

382

mTERF

PF02536 mTERF 51-226 aa PF02536 mTERF 251-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794579.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	51	226	4.2e-26	92.3	mTERF
`XP_057794579.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	251	356	4.2e-26	92.3	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938596.1
AATTGCAATTTCCCTGCACACGAATTACCATCATCTTAAACCTACCCTGGTAACGAAGCTGATTTTTGCATCGCCGGTGCTTTATCTTCTCAGGCAAGCGATTTTCTTCTCTTCAAAAGATCAACAATTCATTTTCTTTAAGTATTCAATCGTCACTTCTTTCTTTCTCGTGAATATGACTGCAGTTTTGCGCAAAGATTCCGTTGGTATATTATTGAGGAATTCCTCGAATCTATGCAAATCTAGGGTTCCATTTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010894
ATGACTGCAGTTTTGCGCAAAGATTCCGTTGGTATATTATTGAGGAATTCCTCGAATCTATGCAAATCTAGGGTTCCATTTTCGACTTCATTCCATCACTTGTACTCCATATCCACGGAGAAGAAACCCAAAATCAATCCCGCAGTTTACGATTTCTTGTTTCAACAACACAATTTCTCTCCCGAAGCAGCCGCGGAAGCCGCCTCTGTCATAACCCGTTTAAGGAACCGGGAAAAATCCGATTCCCTTTTCTCGTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794579.1
MTAVLRKDSVGILLRNSSNLCKSRVPFSTSFHHLYSISTEKKPKINPAVYDFLFQQHNFSPEAAAEAASVITRLRNREKSDSLFSFLEKNDFSSSHLEKIVKYKPSFISIDLEKSVKPKIKIFQELGLSNSDIADLFAGNASVFYRSTDKRVIPALSKLRGLLGSNASVVNLLMKSGRFLIRDLDKTMVPNIEFLRSRGVPMEQIITSMHCFSRFLLHKPEHVRRSAGKAEGLGARRGSRMYIHAVRVVASMSDEVWELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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