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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004045`

染色体: Chr02 坐标: 62756637-62760204 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004045`
名称	SmilChr02G004045
描述	catalase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62756637 - 62760204 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010978`
GeneID	`131010978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010978`
原始查询	`LOC131010978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	catalase
产物	catalase
Arabidopsis	`AT4G35090` (CAT2) catalase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829661] identity=87.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0131200` (CATC) - identity=87.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004096 (catalase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005777 (peroxisome); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0020037 (heme binding); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00199 (Catalase); PF06628 (Catalase-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057794683.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794683.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794683.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794683.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62757019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:62758324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B134,B47,B70,C60
`Chr2:62758615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr2:62758928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D7
`Chr2:62759631`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C77
`Chr2:62759631`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794683.1

492 aa

246

492

Catalase

Catalase-rel

PF00199 Catalase 18-397 aa PF06628 Catalase-rel 423-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794683.1`	Pfam	`PF00199`	Catalase	Domain	18	397	1.2e-172	575.0	Catalase
`XP_057794683.1`	Pfam	`PF06628`	Catalase-rel	Family	423	486	1.3e-15	58.0	Catalase-related immune-responsive

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938700.1
ATAGAAAATAGAAATGCGAGCCACGAAAAATAAAGAACAAAATCTATAAATAAGTAAAATAATTAAATAATAAAAAGGAGGTCCCTACCACTTTGTATATACTATAAATAATCAGTTTTTTCTATTTTAAAGCCGCTAAACTCCCATTTTCGAACAAAGCTCTCGTGAAATTCCTTCTGACTTCTCTATCTTCTCGCTCTAGAAATGGATCCTTACAGGTACCGTCCGTCGAGTGCTTTCAATTCATCTTTTATGACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010978
ATGGATCCTTACAGGTACCGTCCGTCGAGTGCTTTCAATTCATCTTTTATGACCACGAATTCTGGAGCTCCAGTTTGGAACAACAACAACTCTTTGACTGTTGGGAGTAGAGGTCCAATCCTGCTTGAAGATTATCATTTGGTGGAGAAACTTGCTAACTTCGACCGTGAGAGGATCCCAGAACGTGTTGTCCATGCCAGAGGTGCCAGTGCCAAGGGATTTTTCGAGGTCACTCATGATATCACTCACCTTACTTGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794683.1
MDPYRYRPSSAFNSSFMTTNSGAPVWNNNNSLTVGSRGPILLEDYHLVEKLANFDRERIPERVVHARGASAKGFFEVTHDITHLTCADFLRAPGVQTPVIVRFSTVIHERGSPETLRDPRGFAVKFYTREGNFDMVGNNFPVFFVRDGMKFPDMVHALKPNPKSHIQENWRILDFFSHHPESLHMFTFLFDDLGVPQDYRHMDGSGVNTYTLINKAGKVNYVKFHWKPTCGVKCLLEDEAVKVGGTNHSHATQDLYDSIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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